More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0140 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0140  ATPase, FliI/YscN family  100 
 
 
436 aa  832    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  57.24 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  54.98 
 
 
435 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  54.78 
 
 
439 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  55.34 
 
 
453 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  54.25 
 
 
459 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  52.11 
 
 
446 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  49.03 
 
 
437 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  49.63 
 
 
437 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  53.59 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  54.39 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  50.37 
 
 
431 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  51.83 
 
 
436 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  48.67 
 
 
437 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  47.32 
 
 
427 aa  391  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  47.07 
 
 
438 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  46.14 
 
 
426 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  49.04 
 
 
433 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  52.16 
 
 
454 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  49.28 
 
 
422 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  50.36 
 
 
436 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  47.87 
 
 
437 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  51.47 
 
 
489 aa  382  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  45.06 
 
 
439 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  46.82 
 
 
443 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  50.72 
 
 
458 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  50.72 
 
 
458 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  45.97 
 
 
434 aa  378  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  48.46 
 
 
437 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  46.21 
 
 
443 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.8 
 
 
433 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  50.25 
 
 
461 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  48.91 
 
 
441 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  49.51 
 
 
449 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  44.65 
 
 
434 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  45.95 
 
 
434 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  46.33 
 
 
464 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  45.71 
 
 
434 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  48.25 
 
 
446 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  47.57 
 
 
440 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  48.31 
 
 
445 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  47.95 
 
 
445 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  46.76 
 
 
442 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  48.31 
 
 
445 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  49.26 
 
 
446 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.67 
 
 
442 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  48.79 
 
 
445 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  48.34 
 
 
446 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  48.31 
 
 
445 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  50.24 
 
 
440 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  49 
 
 
446 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  47.37 
 
 
446 aa  363  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  51.67 
 
 
441 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  46.43 
 
 
435 aa  362  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  46.15 
 
 
463 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  44.15 
 
 
442 aa  362  7.0000000000000005e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.99 
 
 
474 aa  362  8e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  47.1 
 
 
450 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  47.79 
 
 
441 aa  361  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.95 
 
 
441 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  48.05 
 
 
443 aa  361  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  47.23 
 
 
446 aa  360  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  48.55 
 
 
442 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  46.78 
 
 
439 aa  359  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.94 
 
 
443 aa  359  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  44.37 
 
 
504 aa  358  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  49.35 
 
 
440 aa  358  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  46.42 
 
 
480 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  46.06 
 
 
458 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  46.84 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  47.57 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  47.69 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  50.13 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  48.01 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  47.33 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  47.33 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  46.92 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  48.3 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  47.57 
 
 
445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  48.33 
 
 
441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  47.13 
 
 
458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  48.08 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  46.74 
 
 
439 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  48.17 
 
 
449 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  43.68 
 
 
443 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  44.25 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  46.77 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  47.04 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  46.31 
 
 
488 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  47.69 
 
 
442 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  47.73 
 
 
454 aa  352  8.999999999999999e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  46.9 
 
 
439 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  43.28 
 
 
436 aa  351  1e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  45.8 
 
 
445 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.27 
 
 
439 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  46.67 
 
 
447 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  45.48 
 
 
439 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  45.86 
 
 
441 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  48.09 
 
 
441 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  47.47 
 
 
459 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>