More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1101 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
460 aa  929    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  62.28 
 
 
463 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.5 
 
 
455 aa  585  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  59.96 
 
 
460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  59.96 
 
 
460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  57.3 
 
 
461 aa  557  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  57.02 
 
 
461 aa  555  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  58.68 
 
 
469 aa  556  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.25 
 
 
472 aa  553  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  58.99 
 
 
463 aa  550  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  58.02 
 
 
459 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.19 
 
 
459 aa  550  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.81 
 
 
459 aa  546  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  58.19 
 
 
460 aa  544  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  57.74 
 
 
460 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  57.3 
 
 
460 aa  537  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  57.46 
 
 
466 aa  537  1e-151  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  56.22 
 
 
462 aa  535  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  56.19 
 
 
455 aa  538  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  54.39 
 
 
464 aa  533  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  55.56 
 
 
462 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  55.56 
 
 
462 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  56 
 
 
462 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  57.71 
 
 
466 aa  528  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  57.27 
 
 
464 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  56.7 
 
 
462 aa  521  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  55.36 
 
 
477 aa  522  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  55.87 
 
 
471 aa  519  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  55.73 
 
 
460 aa  518  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  55.38 
 
 
467 aa  518  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  55.51 
 
 
474 aa  520  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  56.59 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  55.13 
 
 
467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  55.16 
 
 
467 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  54.46 
 
 
467 aa  512  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  55.91 
 
 
472 aa  513  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  55.82 
 
 
461 aa  514  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  55.13 
 
 
472 aa  514  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  54.27 
 
 
479 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.83 
 
 
466 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  54.97 
 
 
463 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  56.02 
 
 
471 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  53.98 
 
 
470 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  54.85 
 
 
458 aa  504  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  54.08 
 
 
454 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.17 
 
 
466 aa  501  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  53.42 
 
 
460 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  52.72 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  51.2 
 
 
507 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  52.21 
 
 
508 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  51.31 
 
 
515 aa  480  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  50.66 
 
 
506 aa  480  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  50.22 
 
 
505 aa  473  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  49.46 
 
 
460 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  50.23 
 
 
475 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  50.9 
 
 
477 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  50.45 
 
 
477 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.74 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  47.86 
 
 
440 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  38.52 
 
 
452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  39.09 
 
 
458 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.78 
 
 
431 aa  266  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  37.47 
 
 
434 aa  266  7e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  37.83 
 
 
438 aa  260  3e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  35.54 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  37.81 
 
 
440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  35.09 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.88 
 
 
438 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  31.88 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.44 
 
 
437 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  31.92 
 
 
431 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  33.78 
 
 
443 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  31.22 
 
 
480 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  31.59 
 
 
442 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  34.77 
 
 
464 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  31.06 
 
 
442 aa  156  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  33.02 
 
 
436 aa  155  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  32.46 
 
 
451 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  33.51 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  30.79 
 
 
437 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  34.27 
 
 
439 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  35.82 
 
 
439 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  30.79 
 
 
485 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  34.17 
 
 
486 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  33.14 
 
 
470 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  32.43 
 
 
441 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  34.87 
 
 
439 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  32.71 
 
 
436 aa  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  32.87 
 
 
439 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  35.82 
 
 
439 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  32.16 
 
 
451 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  32.12 
 
 
446 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  31.34 
 
 
444 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  30.35 
 
 
437 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  29.5 
 
 
463 aa  150  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  32.09 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  30.18 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  31.78 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  31.81 
 
 
552 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  32.56 
 
 
513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>