More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48891 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  85.22 
 
 
507 aa  840    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  77.41 
 
 
515 aa  833    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  100 
 
 
508 aa  1038    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  75.26 
 
 
506 aa  768    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  74.16 
 
 
505 aa  720    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.29 
 
 
459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  59.74 
 
 
460 aa  579  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  59 
 
 
469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  56.99 
 
 
459 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  54.8 
 
 
464 aa  553  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  56.16 
 
 
462 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.33 
 
 
472 aa  550  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  56.99 
 
 
460 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  56.99 
 
 
460 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  56.77 
 
 
461 aa  551  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  56.43 
 
 
460 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  55.72 
 
 
462 aa  547  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  55.67 
 
 
462 aa  548  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  56.16 
 
 
462 aa  547  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  55.36 
 
 
460 aa  542  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  56.9 
 
 
472 aa  541  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  56.86 
 
 
464 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  55.97 
 
 
462 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  56.53 
 
 
460 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  57.52 
 
 
466 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  56.01 
 
 
471 aa  535  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  54.94 
 
 
460 aa  537  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  56.92 
 
 
471 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  54.47 
 
 
474 aa  534  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  53.7 
 
 
455 aa  533  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  56.74 
 
 
471 aa  529  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.11 
 
 
459 aa  531  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  54.09 
 
 
460 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  54.62 
 
 
458 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.53 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  52.05 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  54 
 
 
463 aa  514  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  53.78 
 
 
461 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  53.35 
 
 
466 aa  509  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.1 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  53.59 
 
 
470 aa  505  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  52.71 
 
 
463 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  52.72 
 
 
463 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  52.72 
 
 
477 aa  491  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  50.32 
 
 
467 aa  490  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  50.54 
 
 
467 aa  488  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  49.89 
 
 
467 aa  486  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  49.58 
 
 
479 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  50.11 
 
 
467 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  52.18 
 
 
460 aa  484  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  49.89 
 
 
472 aa  475  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.33 
 
 
455 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  51.56 
 
 
460 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  48.91 
 
 
454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  50.11 
 
 
477 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  50.11 
 
 
475 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  50.44 
 
 
477 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.76 
 
 
466 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  46.53 
 
 
440 aa  412  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.03 
 
 
458 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  36.44 
 
 
452 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  35.84 
 
 
438 aa  259  9e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  34.1 
 
 
443 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  35.13 
 
 
431 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.45 
 
 
434 aa  249  1e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  34.74 
 
 
439 aa  240  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  36.12 
 
 
440 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.14 
 
 
427 aa  162  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  29.91 
 
 
438 aa  160  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  27.33 
 
 
437 aa  153  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  28.31 
 
 
439 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  27.45 
 
 
437 aa  146  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  30.21 
 
 
440 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  30 
 
 
437 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  28.53 
 
 
439 aa  143  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  30.6 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  27.14 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  28.73 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1777  flagellum-specific ATP synthase  28.95 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  31.99 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  28.6 
 
 
443 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  27.87 
 
 
442 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  28.65 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1695  flagellum-specific ATP synthase  31.53 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  28.13 
 
 
452 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  33.02 
 
 
436 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  29.84 
 
 
439 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1495  flagellum-specific ATP synthase  28.43 
 
 
435 aa  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  28.95 
 
 
465 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  28.07 
 
 
480 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  31.37 
 
 
438 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2155  flagellar protein export ATPase FliI  30.12 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  29.2 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.73 
 
 
476 aa  137  5e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  27.48 
 
 
451 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  30.39 
 
 
436 aa  137  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  27.21 
 
 
440 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  30.13 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  27.41 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  27.23 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>