More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0548 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  94.81 
 
 
462 aa  892    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  98.48 
 
 
462 aa  927    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  66.89 
 
 
462 aa  635    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  68.28 
 
 
459 aa  659    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  85 
 
 
464 aa  810    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  98.92 
 
 
462 aa  929    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
462 aa  937    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  66.96 
 
 
460 aa  632  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  67.33 
 
 
464 aa  633  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  67.33 
 
 
461 aa  631  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  66.59 
 
 
469 aa  628  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  64.38 
 
 
460 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  64.38 
 
 
460 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  64.98 
 
 
459 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  65.19 
 
 
472 aa  625  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  65.78 
 
 
460 aa  616  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  62.91 
 
 
460 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  65.04 
 
 
460 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  64.38 
 
 
466 aa  610  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  65.34 
 
 
458 aa  610  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  62.33 
 
 
459 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  62.25 
 
 
460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  62.86 
 
 
463 aa  598  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  61.2 
 
 
455 aa  593  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  62.03 
 
 
466 aa  590  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  61.01 
 
 
460 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  63.54 
 
 
472 aa  586  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.59 
 
 
466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  63.52 
 
 
471 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  62.36 
 
 
471 aa  580  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  61.23 
 
 
470 aa  579  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  62.11 
 
 
471 aa  580  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  61.14 
 
 
474 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  57.52 
 
 
463 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  54.89 
 
 
507 aa  546  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  55.72 
 
 
508 aa  547  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  56.1 
 
 
461 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  54.33 
 
 
506 aa  545  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  58.41 
 
 
472 aa  546  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  56.09 
 
 
466 aa  543  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  56.11 
 
 
463 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  55.46 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  53.5 
 
 
515 aa  536  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  55.56 
 
 
460 aa  531  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  55.82 
 
 
467 aa  528  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  54.97 
 
 
479 aa  521  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  55.16 
 
 
467 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  55.78 
 
 
477 aa  520  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  52.74 
 
 
461 aa  521  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  54.29 
 
 
467 aa  518  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.28 
 
 
455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  54.95 
 
 
467 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  55.78 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  54.71 
 
 
475 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  55.38 
 
 
477 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  55.3 
 
 
477 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  49.67 
 
 
454 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.33 
 
 
466 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  50.23 
 
 
440 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  35.47 
 
 
458 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  34.76 
 
 
452 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.98 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.05 
 
 
438 aa  272  1e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.48 
 
 
443 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.12 
 
 
431 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  36.04 
 
 
439 aa  253  6e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  37.08 
 
 
440 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.23 
 
 
427 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  30 
 
 
438 aa  176  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.16 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  30.88 
 
 
437 aa  170  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  35.59 
 
 
460 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  31.22 
 
 
451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  31.02 
 
 
451 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30.34 
 
 
443 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  31.16 
 
 
435 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  31.08 
 
 
444 aa  159  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  32.5 
 
 
439 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  33.12 
 
 
439 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  30.83 
 
 
446 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  29.04 
 
 
458 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  30.68 
 
 
445 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  31.68 
 
 
434 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  30.38 
 
 
445 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  33.33 
 
 
460 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1091  flagella ATPase FliI  32.31 
 
 
464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  30.09 
 
 
439 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  33.02 
 
 
452 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  29.51 
 
 
434 aa  156  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  33.02 
 
 
452 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  30.28 
 
 
431 aa  156  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  33.94 
 
 
448 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  27.42 
 
 
448 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  31.98 
 
 
435 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  33.11 
 
 
449 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  32.88 
 
 
464 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  30.24 
 
 
444 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  33.11 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  30.38 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  30.07 
 
 
436 aa  154  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>