More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0962 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 
466 aa  950    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  76.46 
 
 
470 aa  732    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  93.99 
 
 
466 aa  907    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  63.36 
 
 
466 aa  599  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  64.13 
 
 
460 aa  597  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  63.46 
 
 
461 aa  594  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  62.26 
 
 
460 aa  592  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  61.64 
 
 
464 aa  591  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  63.22 
 
 
462 aa  589  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  62.47 
 
 
462 aa  588  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  64.02 
 
 
458 aa  587  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  63.05 
 
 
464 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.87 
 
 
459 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  61.59 
 
 
462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  61.59 
 
 
462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  60.75 
 
 
463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  61.59 
 
 
462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  60.39 
 
 
459 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  61.01 
 
 
460 aa  567  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.33 
 
 
472 aa  565  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  60.69 
 
 
471 aa  567  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  60.31 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  60.31 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  59.32 
 
 
474 aa  559  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  61.84 
 
 
471 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  58.61 
 
 
469 aa  557  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  60.39 
 
 
472 aa  556  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  58.76 
 
 
455 aa  556  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  57.99 
 
 
460 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  59.83 
 
 
471 aa  551  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  58.64 
 
 
460 aa  551  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.15 
 
 
459 aa  551  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  56.8 
 
 
460 aa  545  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  55.63 
 
 
461 aa  536  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  57.27 
 
 
472 aa  530  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  57.08 
 
 
463 aa  525  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  54.17 
 
 
463 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  54.78 
 
 
506 aa  527  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  54.45 
 
 
505 aa  523  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  56.64 
 
 
466 aa  520  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  54.61 
 
 
460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  56.76 
 
 
477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  52.8 
 
 
507 aa  511  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  56.76 
 
 
477 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  53.03 
 
 
479 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  56.54 
 
 
475 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  52.24 
 
 
515 aa  506  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  53.81 
 
 
508 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.08 
 
 
455 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  53.7 
 
 
461 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  52.17 
 
 
460 aa  501  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  51.88 
 
 
454 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  53.98 
 
 
467 aa  486  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  53.32 
 
 
467 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  53.1 
 
 
467 aa  482  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  53.74 
 
 
477 aa  484  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  53.32 
 
 
467 aa  484  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  52.07 
 
 
440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.44 
 
 
466 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.93 
 
 
458 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
452 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.78 
 
 
438 aa  272  1e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.92 
 
 
431 aa  267  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
443 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  36.61 
 
 
439 aa  261  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  38.41 
 
 
440 aa  254  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.37 
 
 
434 aa  253  7e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  31.54 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  30.96 
 
 
438 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  30.31 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.78 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  37.77 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  37.04 
 
 
436 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  31.45 
 
 
437 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  33.33 
 
 
456 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  31.69 
 
 
443 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  31.28 
 
 
432 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  31.9 
 
 
439 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  30.99 
 
 
480 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1482  flagellum-specific ATP synthase  31.16 
 
 
436 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  31.9 
 
 
439 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  32.84 
 
 
456 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  32.95 
 
 
472 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  32.19 
 
 
438 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  31.25 
 
 
434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0205  flagellum-specific ATP synthase  34.08 
 
 
461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  32.19 
 
 
438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0226  flagellum-specific ATP synthase  34.08 
 
 
461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0188  flagellum-specific ATP synthase  34.08 
 
 
461 aa  156  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  31.9 
 
 
439 aa  156  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  32.99 
 
 
431 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  34.93 
 
 
443 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  29.74 
 
 
449 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  32.26 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  30.41 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  32.76 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  30.66 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  31.48 
 
 
549 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  32.38 
 
 
514 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  32.38 
 
 
513 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>