More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1608 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  75.49 
 
 		 462 aa  720    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  72.59 
 
 		 460 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  74.95 
 
 		 460 aa  714    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  72.31 
 
 		 458 aa  684    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  75.76 
 
 		 464 aa  722    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  75 
 
 		 460 aa  715    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 463 aa  943    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  77.34 
 
 		 461 aa  730    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  67.32 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  68.13 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  66.16 
 
 		 459 aa  625  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  67.17 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  66.23 
 
 		 474 aa  622  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  66.37 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  63.52 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  62.56 
 
 		 464 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  62.86 
 
 		 462 aa  599  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  63.3 
 
 		 462 aa  601  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  62.86 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  63.6 
 
 		 459 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  64.24 
 
 		 466 aa  588  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.4 
 
 		 466 aa  585  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.29 
 
 		 472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.75 
 
 		 466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  61.28 
 
 		 469 aa  578  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  61.35 
 
 		 460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  60.75 
 
 		 460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  60.93 
 
 		 455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  59.34 
 
 		 460 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  59.34 
 
 		 460 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  60.35 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.77 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  59.47 
 
 		 472 aa  546  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  58.61 
 
 		 460 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  57.33 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  54.66 
 
 		 505 aa  532  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  54.55 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  56.67 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  55.43 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  55.73 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  53.91 
 
 		 506 aa  519  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  56.51 
 
 		 467 aa  511  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  56.07 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  56.07 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  52.94 
 
 		 508 aa  508  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  52.99 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  52.37 
 
 		 515 aa  505  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  54.97 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  55.85 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.18 
 
 		 455 aa  504  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  56.85 
 
 		 460 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  51.42 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  51.77 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  54.82 
 
 		 477 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  55.04 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  54.75 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  54.52 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  50.66 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.71 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  36.24 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  36.03 
 
 		 452 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.37 
 
 		 434 aa  267  2e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.32 
 
 		 431 aa  266  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  37.2 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  36.52 
 
 		 438 aa  255  9e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  35.46 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  35.46 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.41 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  30.69 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  30.41 
 
 		 438 aa  156  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  30.49 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  31.84 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  29.79 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  30.15 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  28.33 
 
 		 463 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  29.2 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  29.81 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  29.81 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  30.4 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  29.81 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  30.1 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  28.05 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  30.79 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  32 
 
 		 458 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  28.5 
 
 		 438 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  27.79 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  28.43 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  31.69 
 
 		 435 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  29.57 
 
 		 449 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  30.84 
 
 		 452 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  30.84 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  31.69 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  27.47 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  29.35 
 
 		 449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  32.06 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  30.91 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  29.7 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  29.04 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  30.22 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>