More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1889 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  76.65 
 
 		 455 aa  739    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  65.04 
 
 		 462 aa  634    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  66 
 
 		 460 aa  639    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  80 
 
 		 459 aa  767    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 460 aa  934    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 460 aa  934    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  80.22 
 
 		 460 aa  766    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  73.23 
 
 		 472 aa  699    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  80.4 
 
 		 459 aa  770    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  75.5 
 
 		 460 aa  721    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  64.38 
 
 		 462 aa  628  1e-179  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  64.82 
 
 		 462 aa  630  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  64.38 
 
 		 462 aa  629  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  63.5 
 
 		 464 aa  623  1e-177  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  65.04 
 
 		 459 aa  619  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  62.17 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  62.77 
 
 		 471 aa  597  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  61.74 
 
 		 474 aa  596  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  61.96 
 
 		 472 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  61.74 
 
 		 471 aa  590  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  61.23 
 
 		 464 aa  588  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  61.93 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  60.79 
 
 		 462 aa  586  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  62 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  60.88 
 
 		 460 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  60.66 
 
 		 460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  61.45 
 
 		 460 aa  578  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  60.79 
 
 		 461 aa  580  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  59.47 
 
 		 463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  59.96 
 
 		 460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  58.67 
 
 		 461 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  59.91 
 
 		 466 aa  570  1e-161  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.53 
 
 		 466 aa  568  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  60 
 
 		 458 aa  569  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  59.34 
 
 		 463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.31 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  57.62 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  57.49 
 
 		 461 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  56.99 
 
 		 508 aa  549  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  56.33 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  56.46 
 
 		 506 aa  544  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  56.99 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  55.75 
 
 		 515 aa  539  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  55.46 
 
 		 505 aa  535  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  57.62 
 
 		 472 aa  528  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  55.68 
 
 		 467 aa  524  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  55.9 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  55.23 
 
 		 467 aa  522  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  55.68 
 
 		 467 aa  525  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  55.09 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  52.99 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.11 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  53.45 
 
 		 460 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  52.2 
 
 		 454 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  53.67 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  52.86 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  52.64 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  49.65 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.01 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  39.69 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  37.09 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.09 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  37.91 
 
 		 431 aa  293  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  37.14 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.73 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  39.47 
 
 		 440 aa  260  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  37.88 
 
 		 439 aa  256  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  32.18 
 
 		 427 aa  183  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.95 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  31.44 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  28.5 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  32.39 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  30.35 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  31.08 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  29.72 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  32.12 
 
 		 437 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  31.62 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  33.15 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  31.52 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  32.49 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  32.49 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  32.49 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  30.31 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  32.47 
 
 		 440 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  32.08 
 
 		 449 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  32.93 
 
 		 451 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  30.97 
 
 		 435 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  31.82 
 
 		 451 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.36 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  30.3 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  31.43 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  30.11 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  33.52 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  30.75 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  33.05 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  31.78 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  32.09 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  31.09 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  33.15 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  27.3 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>