More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2268 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  70.04 
 
 		 455 aa  674    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  80.04 
 
 		 460 aa  766    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  82.35 
 
 		 459 aa  776    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  80.22 
 
 		 460 aa  766    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  80.22 
 
 		 460 aa  766    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  73.45 
 
 		 472 aa  697    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  67.54 
 
 		 460 aa  649    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  75.66 
 
 		 459 aa  713    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 460 aa  931    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  63.58 
 
 		 462 aa  620  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  64.49 
 
 		 459 aa  620  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  63.13 
 
 		 462 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  63.58 
 
 		 462 aa  617  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  62.47 
 
 		 464 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  62.91 
 
 		 462 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  63.08 
 
 		 462 aa  595  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  62.86 
 
 		 460 aa  592  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  62.2 
 
 		 461 aa  590  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  61.76 
 
 		 460 aa  588  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  62 
 
 		 466 aa  588  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  62.42 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  60.84 
 
 		 469 aa  584  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  60.39 
 
 		 471 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  61.35 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  60 
 
 		 474 aa  571  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  60.65 
 
 		 471 aa  569  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  60.75 
 
 		 458 aa  571  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  59.11 
 
 		 461 aa  565  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  59.12 
 
 		 463 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  60.22 
 
 		 460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  58.72 
 
 		 472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  59.74 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  59.03 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.42 
 
 		 466 aa  554  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.64 
 
 		 466 aa  551  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  57.74 
 
 		 460 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  57.21 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  55.08 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  54.59 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  55.19 
 
 		 463 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  54.21 
 
 		 506 aa  522  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  53.23 
 
 		 515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  54.87 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  53.91 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  54.79 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  53.35 
 
 		 507 aa  509  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.43 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  54.34 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  54.57 
 
 		 467 aa  511  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  53.22 
 
 		 479 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  53.9 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  55.07 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  55.3 
 
 		 460 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  50.22 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  54.07 
 
 		 477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  53.52 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  54.44 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  49.31 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.9 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  38.41 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.98 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  40.31 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  38.21 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  36.24 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.82 
 
 		 443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  38.66 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  38.12 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  32.41 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  32.45 
 
 		 438 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  34.46 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  34.77 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  32.16 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  34.15 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  30.26 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  33.44 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  31.89 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.31 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  30.68 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  29.36 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  32.24 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  32.88 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  30.14 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  30.19 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  36.27 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  30.46 
 
 		 485 aa  154  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  30.77 
 
 		 451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  30.29 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  32.19 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  31.3 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  32.7 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  31.48 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  30.51 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  30.98 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  30.41 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  29.82 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  32.73 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  30.15 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1091  flagella ATPase FliI  31.92 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  31.5 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  29.3 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>