More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1438 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  69.96 
 
 
461 aa  659    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
471 aa  945    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  79.75 
 
 
474 aa  753    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  82.89 
 
 
471 aa  757    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  81.99 
 
 
472 aa  770    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  69.3 
 
 
462 aa  652    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  80.77 
 
 
471 aa  757    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  68.64 
 
 
460 aa  650    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  67.4 
 
 
458 aa  643    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  68.18 
 
 
464 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  66.45 
 
 
460 aa  633  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  66.37 
 
 
460 aa  631  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  66.37 
 
 
463 aa  615  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  64.78 
 
 
459 aa  605  9.999999999999999e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  62.99 
 
 
460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  62.99 
 
 
460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  62.64 
 
 
464 aa  595  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  62.56 
 
 
462 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  62.56 
 
 
462 aa  586  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.71 
 
 
472 aa  585  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  61.66 
 
 
459 aa  584  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  62.11 
 
 
462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  62.11 
 
 
462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  60.61 
 
 
460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  59.39 
 
 
455 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  60.75 
 
 
460 aa  569  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  62.33 
 
 
466 aa  567  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  61.27 
 
 
469 aa  565  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.48 
 
 
459 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  57.42 
 
 
460 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.83 
 
 
466 aa  554  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.39 
 
 
466 aa  552  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  59.87 
 
 
470 aa  551  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  57.2 
 
 
505 aa  550  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  57.77 
 
 
461 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  55.3 
 
 
506 aa  541  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  57.24 
 
 
463 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  57.3 
 
 
508 aa  538  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  56.06 
 
 
515 aa  535  1e-150  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  55.77 
 
 
507 aa  521  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  55.87 
 
 
460 aa  521  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  55.58 
 
 
463 aa  519  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  55.36 
 
 
466 aa  514  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  54.63 
 
 
467 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  53.96 
 
 
467 aa  504  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  54.19 
 
 
467 aa  503  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  52.09 
 
 
461 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  53.96 
 
 
467 aa  501  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  52.13 
 
 
479 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  53.85 
 
 
472 aa  496  1e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  52.79 
 
 
477 aa  492  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.91 
 
 
455 aa  488  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  54.1 
 
 
460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  49.78 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  52.99 
 
 
477 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  53.57 
 
 
477 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  52.99 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  49.66 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.73 
 
 
466 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.97 
 
 
458 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  37.39 
 
 
452 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  36.32 
 
 
434 aa  277  3e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  37.23 
 
 
431 aa  271  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  37.55 
 
 
438 aa  271  2e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  37.29 
 
 
443 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  34.79 
 
 
440 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  29.47 
 
 
427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  33.33 
 
 
443 aa  174  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  29.47 
 
 
438 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  31.54 
 
 
434 aa  171  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.7 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  33.23 
 
 
465 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  31.97 
 
 
443 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  31.98 
 
 
439 aa  158  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  32.03 
 
 
438 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  28.31 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  34.92 
 
 
460 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  32.27 
 
 
452 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  32.27 
 
 
452 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  32.28 
 
 
451 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  30.33 
 
 
437 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  27.57 
 
 
510 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  30.42 
 
 
451 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  31.41 
 
 
431 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  31.19 
 
 
437 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  30.81 
 
 
439 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  34.39 
 
 
464 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  29.95 
 
 
442 aa  150  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2085  flagellum-specific ATP synthase  32.62 
 
 
436 aa  149  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  28.64 
 
 
439 aa  149  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  30.6 
 
 
480 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  33.42 
 
 
435 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  29.87 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  31.41 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  32.73 
 
 
440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  29.95 
 
 
438 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  30.31 
 
 
444 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  30.64 
 
 
449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  30.09 
 
 
512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>