More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3354 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  92.36 
 
 
472 aa  859    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  70.66 
 
 
461 aa  674    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  67.83 
 
 
460 aa  638    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  81.91 
 
 
471 aa  759    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  71.09 
 
 
464 aa  667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  68.09 
 
 
460 aa  654    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  87.66 
 
 
471 aa  808    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  68.19 
 
 
460 aa  643    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  68.98 
 
 
458 aa  648    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  86.85 
 
 
474 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  70.65 
 
 
462 aa  667    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  100 
 
 
471 aa  943    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  67.76 
 
 
463 aa  634  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  64.85 
 
 
459 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  63.18 
 
 
464 aa  600  1e-170  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  61.96 
 
 
460 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  61.96 
 
 
460 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  63.1 
 
 
462 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  61.3 
 
 
455 aa  590  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  63.1 
 
 
462 aa  590  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  63.32 
 
 
462 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  63.32 
 
 
462 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  62.31 
 
 
472 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  60.34 
 
 
459 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  61.09 
 
 
460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  61.79 
 
 
466 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.26 
 
 
466 aa  567  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.47 
 
 
466 aa  567  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  59.27 
 
 
460 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.57 
 
 
459 aa  565  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  59.57 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  59.78 
 
 
469 aa  561  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  60.87 
 
 
470 aa  553  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  58.66 
 
 
461 aa  545  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  57.05 
 
 
463 aa  547  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  56.45 
 
 
506 aa  547  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  55.81 
 
 
515 aa  543  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  57.7 
 
 
508 aa  543  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  56.84 
 
 
505 aa  541  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  56.49 
 
 
507 aa  531  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  56.4 
 
 
466 aa  530  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  56.64 
 
 
472 aa  527  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  55.75 
 
 
463 aa  524  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  56.13 
 
 
460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  54.18 
 
 
467 aa  511  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  53.86 
 
 
467 aa  508  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  53.53 
 
 
467 aa  508  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  53.75 
 
 
467 aa  509  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  51.83 
 
 
461 aa  495  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  52.56 
 
 
479 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  53.13 
 
 
477 aa  494  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.52 
 
 
455 aa  483  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  54.41 
 
 
460 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  54.85 
 
 
477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  50.88 
 
 
454 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  54.99 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  54.41 
 
 
475 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  51.14 
 
 
440 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.65 
 
 
466 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  38.94 
 
 
458 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  38.3 
 
 
452 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  38.2 
 
 
434 aa  286  5e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  38.78 
 
 
431 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.51 
 
 
438 aa  280  6e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  38.98 
 
 
443 aa  273  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  36.5 
 
 
440 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  36.78 
 
 
439 aa  256  8e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  29.33 
 
 
427 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  29.33 
 
 
438 aa  169  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  30.07 
 
 
434 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30.81 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  28.73 
 
 
439 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  29.93 
 
 
443 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.52 
 
 
437 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  31.74 
 
 
465 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  30.42 
 
 
438 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2085  flagellum-specific ATP synthase  32.24 
 
 
436 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  31.69 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  29.95 
 
 
437 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  32.41 
 
 
464 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  30.3 
 
 
442 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  29.65 
 
 
438 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  31.35 
 
 
435 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  31.64 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  34.33 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  27.89 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1777  flagellum-specific ATP synthase  32.69 
 
 
435 aa  153  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  30.79 
 
 
452 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  30.79 
 
 
452 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  29.82 
 
 
440 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  29.98 
 
 
444 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  30 
 
 
436 aa  152  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  31.03 
 
 
480 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  30.56 
 
 
437 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  31.17 
 
 
443 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  29.7 
 
 
437 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  30.38 
 
 
446 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  30.92 
 
 
446 aa  150  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  29.88 
 
 
442 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  33.75 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>