More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1223 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  67.4 
 
 
464 aa  642    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  69.15 
 
 
471 aa  644    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
458 aa  933    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  83.62 
 
 
464 aa  793    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  76.86 
 
 
460 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  83.41 
 
 
461 aa  796    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  67.18 
 
 
471 aa  636    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  82.1 
 
 
460 aa  779    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  77.24 
 
 
460 aa  727    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  68.33 
 
 
472 aa  645    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  72.31 
 
 
463 aa  684    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  83.81 
 
 
462 aa  791    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  66.67 
 
 
471 aa  630  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  65.29 
 
 
474 aa  630  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  66.3 
 
 
462 aa  618  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  66.52 
 
 
459 aa  610  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  65.56 
 
 
462 aa  608  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  65.34 
 
 
462 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  65.34 
 
 
462 aa  608  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  64.02 
 
 
466 aa  587  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  64.3 
 
 
466 aa  585  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  63.13 
 
 
466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.89 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  61.76 
 
 
459 aa  578  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  60.75 
 
 
460 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  60 
 
 
460 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  60 
 
 
460 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  61.15 
 
 
470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  59.6 
 
 
455 aa  561  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  60.57 
 
 
469 aa  558  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  58.82 
 
 
460 aa  552  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.72 
 
 
459 aa  548  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  58.64 
 
 
505 aa  547  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  55.09 
 
 
463 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  57.84 
 
 
460 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  56.36 
 
 
472 aa  528  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  55.43 
 
 
461 aa  525  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  55.39 
 
 
506 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  56.33 
 
 
463 aa  525  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  55.68 
 
 
466 aa  520  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  55 
 
 
508 aa  520  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  54.41 
 
 
507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  55.31 
 
 
515 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  54.85 
 
 
460 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  56.16 
 
 
467 aa  501  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  56.39 
 
 
467 aa  504  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  52.98 
 
 
479 aa  498  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  56.62 
 
 
467 aa  501  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  56.39 
 
 
467 aa  501  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.88 
 
 
455 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  52.1 
 
 
461 aa  495  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  53.74 
 
 
477 aa  489  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  54.98 
 
 
460 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  52.71 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  55 
 
 
477 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  54.71 
 
 
477 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  54.48 
 
 
475 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  52.46 
 
 
440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.51 
 
 
466 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.25 
 
 
458 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  36.82 
 
 
452 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.9 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  37.61 
 
 
438 aa  261  2e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.4 
 
 
431 aa  260  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.43 
 
 
443 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  36.41 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  36.32 
 
 
440 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.17 
 
 
427 aa  170  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  30.17 
 
 
438 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  29.95 
 
 
434 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  30.16 
 
 
442 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  30.79 
 
 
437 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30.24 
 
 
443 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  29.38 
 
 
439 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  30.67 
 
 
438 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  32.23 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  31.19 
 
 
465 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  33.77 
 
 
460 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  30.67 
 
 
440 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  30.15 
 
 
438 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  31.34 
 
 
440 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  29.25 
 
 
431 aa  143  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1777  flagellum-specific ATP synthase  33.14 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  28.92 
 
 
437 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  29.97 
 
 
434 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2085  flagellum-specific ATP synthase  35.34 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  30.68 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  30.06 
 
 
439 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  30.62 
 
 
446 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  27.04 
 
 
437 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1495  flagellum-specific ATP synthase  34.89 
 
 
435 aa  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  28.12 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  33.33 
 
 
439 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  29.48 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  28.08 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  27.86 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  32.1 
 
 
443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  30.5 
 
 
440 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  28.76 
 
 
449 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  29.2 
 
 
443 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>