More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3071 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  68.21 
 
 		 455 aa  668    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  71.08 
 
 		 472 aa  683    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  67.98 
 
 		 460 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  75.5 
 
 		 460 aa  721    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  75.5 
 
 		 460 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 460 aa  939    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  72.81 
 
 		 459 aa  688    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  80.04 
 
 		 460 aa  766    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  75.06 
 
 		 459 aa  716    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  62.25 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  62.03 
 
 		 462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  62.25 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  61.93 
 
 		 459 aa  598  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  61.81 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  60.53 
 
 		 464 aa  597  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  61.11 
 
 		 466 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  60.84 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  60.65 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  60.75 
 
 		 471 aa  568  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  60.13 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  60.3 
 
 		 471 aa  568  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  59.25 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  60.13 
 
 		 460 aa  567  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  60.43 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  59.69 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  59.73 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  60.96 
 
 		 471 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  58.31 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  58.81 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.86 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  58.37 
 
 		 460 aa  553  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.99 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  56.43 
 
 		 508 aa  549  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  58.59 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  56.99 
 
 		 470 aa  545  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  58.61 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  57.71 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  57.84 
 
 		 458 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  54.31 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  57.3 
 
 		 460 aa  537  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  54.76 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  55.11 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  55 
 
 		 506 aa  531  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  54.05 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  55.51 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  53.76 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  52.22 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  51.78 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  51.78 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  51.11 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  52 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.94 
 
 		 455 aa  485  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  50.66 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  53.9 
 
 		 460 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  55.03 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  54.26 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  54.73 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  52.42 
 
 		 440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.53 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  37.74 
 
 		 452 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.83 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.6 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  38.51 
 
 		 431 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  39.23 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  36.84 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.54 
 
 		 443 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  39.17 
 
 		 440 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  32.61 
 
 		 427 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  32.13 
 
 		 438 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  32.31 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  31.66 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  31.4 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  31.78 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  32.78 
 
 		 437 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.87 
 
 		 437 aa  156  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  31.4 
 
 		 445 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  32.04 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  31.94 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  31.47 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  32.33 
 
 		 443 aa  153  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  29.13 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  33.65 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  31.36 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  31.5 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  33.02 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  30.21 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  31.27 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  30.92 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1091  flagella ATPase FliI  36.59 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  31.04 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  32.08 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  33.65 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  35.42 
 
 		 460 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  28.61 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  34.75 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  32.36 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  32.47 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  31.01 
 
 		 480 aa  144  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  31.83 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  30.73 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>