More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2046 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  76.46 
 
 		 466 aa  732    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  76.24 
 
 		 466 aa  734    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 470 aa  956    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  62.25 
 
 		 459 aa  591  1e-167  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  60.78 
 
 		 464 aa  587  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  62.83 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  63.05 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  61.23 
 
 		 462 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  61.23 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  61.01 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  62.83 
 
 		 462 aa  579  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  61.23 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  61.84 
 
 		 460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  61.01 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  61.5 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  61.15 
 
 		 458 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  58.68 
 
 		 459 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  60.35 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  61.09 
 
 		 472 aa  556  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  60.75 
 
 		 460 aa  557  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  59.17 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  60.22 
 
 		 474 aa  551  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.24 
 
 		 472 aa  549  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  59.22 
 
 		 471 aa  547  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  59.87 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  60.53 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  56.99 
 
 		 460 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  56.99 
 
 		 460 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  56.99 
 
 		 460 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  57.21 
 
 		 460 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.48 
 
 		 459 aa  531  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  56.32 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  55.88 
 
 		 455 aa  530  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  54.29 
 
 		 506 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  54.05 
 
 		 460 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  54.47 
 
 		 505 aa  521  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  56.03 
 
 		 466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  53.58 
 
 		 463 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  54.57 
 
 		 507 aa  512  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  56.64 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  56.73 
 
 		 477 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  52.89 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  56.07 
 
 		 475 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  54.77 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  53.59 
 
 		 508 aa  505  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  56.51 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  53.98 
 
 		 460 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.34 
 
 		 455 aa  502  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  53.02 
 
 		 479 aa  498  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  52.51 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  53.54 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  50.77 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  52.16 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  52.89 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  52 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  52 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  52 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  52.3 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.64 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  38.43 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.82 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.15 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.5 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  35.75 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  36.44 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  37.89 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  37.05 
 
 		 440 aa  242  9e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  32.5 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  32.5 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.47 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  28.99 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  31.03 
 
 		 437 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  30.49 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  28.72 
 
 		 434 aa  147  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1482  flagellum-specific ATP synthase  36.2 
 
 		 436 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  30.77 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  31.5 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  34.9 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  32.8 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  31.79 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  29.12 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  29.77 
 
 		 439 aa  143  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  29.32 
 
 		 449 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  36.1 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  29.1 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  32.95 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  30.51 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  30.23 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  29.63 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  31.25 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  36.03 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  32.22 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  30.59 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  31.72 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  31.72 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  34.75 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  31.67 
 
 		 443 aa  140  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  29.11 
 
 		 446 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  31.25 
 
 		 435 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  30.17 
 
 		 443 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>