More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1918 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  87.88 
 
 		 463 aa  852    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 466 aa  948    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.18 
 
 		 459 aa  578  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  59.91 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  59.91 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  57.8 
 
 		 464 aa  568  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  60.13 
 
 		 459 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.31 
 
 		 472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  58.63 
 
 		 455 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  58.54 
 
 		 461 aa  558  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  58.81 
 
 		 460 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  59.03 
 
 		 460 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  56.74 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  56.09 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.63 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  56.09 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  56.54 
 
 		 460 aa  541  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  56.3 
 
 		 462 aa  544  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  57.02 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  55.85 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  56.3 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  56.07 
 
 		 467 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  56.51 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  56.29 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  57.46 
 
 		 460 aa  537  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  56.29 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  56.43 
 
 		 461 aa  531  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  56.36 
 
 		 460 aa  533  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  56.17 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  56.46 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  55.43 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  56.89 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  56.67 
 
 		 463 aa  527  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  55.75 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  55.8 
 
 		 462 aa  525  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  55.53 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  55.36 
 
 		 464 aa  522  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  52.74 
 
 		 469 aa  521  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  55.68 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.64 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  55.99 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  54.68 
 
 		 460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  56.03 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  53.41 
 
 		 479 aa  511  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.82 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  53.59 
 
 		 508 aa  508  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  54.11 
 
 		 506 aa  510  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  55.36 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  53 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.85 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  51.73 
 
 		 515 aa  497  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  52.45 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  52.77 
 
 		 454 aa  481  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  50.11 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  50.34 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  49.89 
 
 		 477 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  49.66 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.58 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  46.33 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  39 
 
 		 458 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  39.69 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  38.56 
 
 		 452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.5 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  36.68 
 
 		 434 aa  257  4e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.34 
 
 		 443 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  37.11 
 
 		 440 aa  243  7e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  36.02 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  30.86 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30.98 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.07 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.53 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  30.07 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  32 
 
 		 487 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  29.68 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  32.18 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  32.18 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  29.9 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  30.3 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  29.66 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  33.04 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.3 
 
 		 476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.66 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.48 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  29.4 
 
 		 439 aa  142  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.38 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.4 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  27.5 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.78 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.38 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  29.38 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  31.11 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  30.5 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  30.43 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.53 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.71 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.87 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  31.72 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  31.45 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  28.06 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.95 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>