More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1025 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.27 
 
 		 465 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 462 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  69.98 
 
 		 470 aa  654    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 467 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.18 
 
 		 470 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 		 481 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 		 470 aa  646    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0506  F0F1 ATP synthase subunit beta  70 
 
 		 473 aa  646    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.452811 
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 		 475 aa  647    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  84.02 
 
 		 465 aa  796    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.88 
 
 		 468 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  69.41 
 
 		 482 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.59 
 
 		 468 aa  644    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.91 
 
 		 473 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 		 463 aa  634    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 472 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.94 
 
 		 469 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.94 
 
 		 469 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.94 
 
 		 469 aa  665    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.54 
 
 		 470 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.56 
 
 		 462 aa  664    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.38 
 
 		 476 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  66.18 
 
 		 547 aa  637    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 		 484 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.74 
 
 		 470 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.45 
 
 		 468 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 		 484 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.99 
 
 		 482 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 		 459 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 		 475 aa  654    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 		 465 aa  635    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 		 475 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 		 468 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 		 468 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  71 
 
 		 467 aa  664    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.61 
 
 		 482 aa  651    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.26 
 
 		 462 aa  659    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.75 
 
 		 470 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.91 
 
 		 470 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.97 
 
 		 471 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.94 
 
 		 469 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  69.93 
 
 		 470 aa  641    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.5 
 
 		 537 aa  635    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  68.25 
 
 		 468 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.2 
 
 		 464 aa  673    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.91 
 
 		 474 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.95 
 
 		 462 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.45 
 
 		 468 aa  660    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.23 
 
 		 464 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 474 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.79 
 
 		 481 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 		 465 aa  642    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.73 
 
 		 469 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.59 
 
 		 474 aa  643    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.3 
 
 		 475 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.33 
 
 		 472 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 		 475 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.41 
 
 		 465 aa  654    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 		 463 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.19 
 
 		 467 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.26 
 
 		 458 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.47 
 
 		 475 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.48 
 
 		 462 aa  657    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 		 503 aa  648    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  70.38 
 
 		 487 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 		 475 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 474 aa  645    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 		 513 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.74 
 
 		 470 aa  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 		 474 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 		 519 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.54 
 
 		 470 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.8 
 
 		 465 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.02 
 
 		 465 aa  693    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 		 462 aa  661    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 493 aa  643    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 		 463 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 		 463 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 484 aa  648    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.58 
 
 		 473 aa  670    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.18 
 
 		 470 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.79 
 
 		 473 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.73 
 
 		 469 aa  662    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.59 
 
 		 469 aa  647    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.4 
 
 		 504 aa  662    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.89 
 
 		 480 aa  642    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.18 
 
 		 466 aa  658    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 		 468 aa  666    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  70.41 
 
 		 471 aa  670    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.88 
 
 		 468 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 		 464 aa  937    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.33 
 
 		 463 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.32 
 
 		 465 aa  640    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 		 471 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 		 471 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 		 462 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 474 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>