More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00570 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  75.4 
 
 
518 aa  757    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.4 
 
 
475 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.32 
 
 
482 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.57 
 
 
471 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.88 
 
 
470 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
467 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.88 
 
 
471 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  65.29 
 
 
487 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
475 aa  645    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
465 aa  638    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3366  ATP synthase F1, beta subunit  69.38 
 
 
469 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.36 
 
 
471 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
465 aa  638    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 
462 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.57 
 
 
521 aa  682    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.72 
 
 
485 aa  683    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.74 
 
 
484 aa  712    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
473 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.72 
 
 
484 aa  638    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3941  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.82 
 
 
478 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.44 
 
 
484 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 
464 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.73 
 
 
476 aa  689    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1108    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.34 
 
 
484 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
462 aa  661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 
470 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1744  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.72 
 
 
485 aa  683    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  0.184526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.04 
 
 
474 aa  693    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.62 
 
 
507 aa  638    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
465 aa  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.38 
 
 
476 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.71 
 
 
476 aa  691    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.57 
 
 
521 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.42 
 
 
473 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.29 
 
 
484 aa  668    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.4 
 
 
475 aa  696    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.03 
 
 
468 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.03 
 
 
468 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  68.29 
 
 
468 aa  656    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
482 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.96 
 
 
478 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 
462 aa  658    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
464 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.88 
 
 
470 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.15 
 
 
470 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
474 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
471 aa  673    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  70.54 
 
 
485 aa  673    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
465 aa  635    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.53 
 
 
465 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.31 
 
 
478 aa  681    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.57 
 
 
474 aa  693    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 
462 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.09 
 
 
474 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.84 
 
 
482 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.29 
 
 
475 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.9 
 
 
476 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.18 
 
 
481 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 
462 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0573  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.64 
 
 
507 aa  639    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.88 
 
 
474 aa  688    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
472 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.69 
 
 
476 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 
462 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.78 
 
 
509 aa  697    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.72 
 
 
470 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
462 aa  648    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.9 
 
 
476 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.08 
 
 
480 aa  685    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 
476 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3652  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.03 
 
 
478 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
465 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.7 
 
 
470 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.07 
 
 
493 aa  682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.31 
 
 
474 aa  696    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.42 
 
 
513 aa  710    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.42 
 
 
517 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
481 aa  669    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.05 
 
 
519 aa  706    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.04 
 
 
537 aa  672    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 
465 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
465 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.32 
 
 
482 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.92 
 
 
483 aa  671    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 
470 aa  677    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  73.62 
 
 
501 aa  719    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.71 
 
 
542 aa  670    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
472 aa  638    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
476 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.28 
 
 
479 aa  661    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  69.04 
 
 
530 aa  702    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  77.4 
 
 
503 aa  773    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
467 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.4 
 
 
475 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.55 
 
 
484 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.71 
 
 
482 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.69 
 
 
484 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
469 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.9 
 
 
474 aa  666    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>