More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3303 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 
460 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.23 
 
 
460 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 
476 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 
470 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.45 
 
 
470 aa  784    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.82 
 
 
470 aa  782    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 
472 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.64 
 
 
475 aa  648    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3317  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
467 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.0243325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.14 
 
 
468 aa  826    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 
465 aa  641    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.3 
 
 
468 aa  729    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 
463 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 
478 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.35 
 
 
469 aa  831    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.35 
 
 
469 aa  831    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.16 
 
 
517 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.35 
 
 
469 aa  831    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.67 
 
 
464 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
458 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  67.87 
 
 
547 aa  640    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 
484 aa  643    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.99 
 
 
481 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
466 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.181857  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.78 
 
 
475 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
467 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 
459 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.96 
 
 
476 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.13 
 
 
482 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.44 
 
 
458 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 
459 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.78 
 
 
475 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 
468 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 
468 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.45 
 
 
470 aa  784    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
482 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.32 
 
 
475 aa  719    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
462 aa  653    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
460 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.24 
 
 
470 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.96 
 
 
470 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.57 
 
 
464 aa  829    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.35 
 
 
469 aa  831    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
468 aa  634    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  70.75 
 
 
503 aa  650    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
484 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.31 
 
 
465 aa  643    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
476 aa  653    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 
474 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.99 
 
 
462 aa  708    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.38 
 
 
480 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 
476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.53 
 
 
481 aa  659    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 
465 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  68.92 
 
 
482 aa  659    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.54 
 
 
476 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 
465 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.53 
 
 
470 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
464 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.95 
 
 
463 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 
476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.87 
 
 
468 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.54 
 
 
476 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
467 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
474 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 
513 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
462 aa  634    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
519 aa  646    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.96 
 
 
465 aa  687    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.18 
 
 
465 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.07 
 
 
484 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.82 
 
 
472 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 
463 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 
463 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
458 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 
475 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
466 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.14 
 
 
479 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.81 
 
 
509 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.56 
 
 
469 aa  748    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.11 
 
 
504 aa  724    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.27 
 
 
480 aa  722    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.6 
 
 
466 aa  726    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.54 
 
 
468 aa  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
469 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.22 
 
 
474 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 
463 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 
470 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
465 aa  639    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 
471 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
471 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>