More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0467 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.52 
 
 
470 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
470 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.68 
 
 
464 aa  723    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.68 
 
 
470 aa  708    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.55 
 
 
468 aa  721    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.33 
 
 
468 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.37 
 
 
468 aa  733    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.97 
 
 
462 aa  642    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.38 
 
 
469 aa  720    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.38 
 
 
469 aa  720    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.38 
 
 
469 aa  720    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.69 
 
 
472 aa  656    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.33 
 
 
468 aa  717    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  73.61 
 
 
467 aa  680    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.11 
 
 
458 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 
475 aa  641    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.04 
 
 
470 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 
471 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.53 
 
 
473 aa  720    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.55 
 
 
468 aa  721    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
468 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
468 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
462 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 
470 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.38 
 
 
465 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.38 
 
 
469 aa  720    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  66.81 
 
 
471 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.32 
 
 
473 aa  719    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  67.78 
 
 
487 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 
462 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.52 
 
 
470 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  68.95 
 
 
464 aa  654    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 
458 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 
463 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  71.03 
 
 
465 aa  669    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.89 
 
 
462 aa  636    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.17 
 
 
469 aa  719    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.03 
 
 
470 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.93 
 
 
465 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.15 
 
 
465 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
463 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
463 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
475 aa  959    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.04 
 
 
470 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.01 
 
 
469 aa  747    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.12 
 
 
504 aa  772    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.25 
 
 
480 aa  776    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.47 
 
 
466 aa  766    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.76 
 
 
468 aa  753    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.17 
 
 
469 aa  718    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 
463 aa  634    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.36 
 
 
471 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.57 
 
 
471 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
463 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
463 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
462 aa  634  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
463 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 
467 aa  634  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.32 
 
 
462 aa  634  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
476 aa  632  1e-180  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
463 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
463 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.9 
 
 
458 aa  631  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.67 
 
 
463 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 
463 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.89 
 
 
462 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
459 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
493 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
465 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.97 
 
 
458 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 
482 aa  630  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
458 aa  628  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 
465 aa  628  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 
503 aa  625  1e-178  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
481 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
481 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06104  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 
461 aa  626  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.82 
 
 
476 aa  626  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3511  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.17 
 
 
468 aa  624  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
467 aa  622  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
460 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 
465 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.67 
 
 
458 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.67 
 
 
458 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.82 
 
 
466 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
458 aa  621  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.68 
 
 
484 aa  621  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  66.67 
 
 
470 aa  622  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
461 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 
465 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
458 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0022  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 
466 aa  619  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0274087  hitchhiker  0.000479158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
459 aa  620  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.85 
 
 
482 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
465 aa  618  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
471 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 
457 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 
484 aa  619  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
458 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.32 
 
 
503 aa  618  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>