More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2844 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2807  ATP synthase F1, beta subunit  65.96 
 
 
469 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.339111 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
465 aa  688    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.73 
 
 
465 aa  705    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.42 
 
 
464 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
470 aa  684    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
459 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 
470 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
476 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.05 
 
 
460 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.85 
 
 
469 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.27 
 
 
468 aa  690    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 
472 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
465 aa  648    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.23 
 
 
468 aa  652    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.56 
 
 
471 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 
503 aa  641    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.27 
 
 
468 aa  690    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.48 
 
 
469 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.48 
 
 
469 aa  691    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.48 
 
 
464 aa  693    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.48 
 
 
469 aa  691    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.27 
 
 
469 aa  689    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.93 
 
 
472 aa  646    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
467 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  67.29 
 
 
547 aa  657    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 
460 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
465 aa  645    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
462 aa  674    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.54 
 
 
470 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.5 
 
 
476 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 
459 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 
476 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
482 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
481 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.21 
 
 
462 aa  664    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.43 
 
 
503 aa  651    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 
465 aa  652    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 
468 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 
468 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.05 
 
 
460 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 
482 aa  670    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
465 aa  641    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
462 aa  673    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
462 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
470 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 
470 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.68 
 
 
458 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.48 
 
 
469 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
484 aa  658    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  73.74 
 
 
487 aa  721    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
458 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 
475 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 
469 aa  646    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.54 
 
 
470 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.21 
 
 
462 aa  744    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.61 
 
 
472 aa  701    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.21 
 
 
467 aa  705    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
467 aa  662    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
476 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  67.36 
 
 
482 aa  659    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
462 aa  676    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
458 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
476 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
471 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.31 
 
 
464 aa  696    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 
463 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 
462 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
458 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.01 
 
 
476 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 
465 aa  644    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.85 
 
 
468 aa  686    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 
470 aa  640    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4332  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.98 
 
 
480 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551629  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 
470 aa  675    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
484 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
475 aa  959    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 
513 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 
472 aa  688    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 
519 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.55 
 
 
465 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.76 
 
 
465 aa  676    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.26 
 
 
457 aa  647    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.19 
 
 
484 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3203  ATP synthase F1, beta subunit  65.96 
 
 
469 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.85 
 
 
468 aa  687    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
458 aa  642    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 
471 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.06 
 
 
476 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
471 aa  676    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.4 
 
 
470 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.05 
 
 
460 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.19 
 
 
469 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
504 aa  656    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.62 
 
 
480 aa  641    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.96 
 
 
466 aa  656    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.22 
 
 
468 aa  668    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
458 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
469 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 
473 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.11 
 
 
463 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>