More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0102 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  69.59 
 
 
518 aa  637    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
460 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  69.91 
 
 
460 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.22 
 
 
470 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
458 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.55 
 
 
503 aa  636    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.48 
 
 
460 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 
475 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
463 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 
468 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.61 
 
 
461 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
465 aa  945    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.99 
 
 
521 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
463 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  69.7 
 
 
459 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 
469 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 
469 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
459 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 
469 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
458 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
458 aa  656    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  67.59 
 
 
547 aa  638    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 
459 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.99 
 
 
521 aa  650    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.65 
 
 
458 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 
537 aa  651    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.9 
 
 
459 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.51 
 
 
476 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
482 aa  653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.61 
 
 
458 aa  648    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 
458 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.36 
 
 
475 aa  664    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.71 
 
 
468 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.71 
 
 
468 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 
464 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
482 aa  665    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.98 
 
 
470 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
462 aa  667    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.33 
 
 
462 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 
470 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 
470 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
464 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 
469 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.9 
 
 
468 aa  783    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
463 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.22 
 
 
470 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  68.22 
 
 
482 aa  659    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.22 
 
 
471 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 
474 aa  668    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 
462 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 
476 aa  643    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.14 
 
 
509 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.94 
 
 
476 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 
481 aa  648    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 
458 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.87 
 
 
474 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.87 
 
 
474 aa  665    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 
462 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 
471 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 
476 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
458 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
463 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 
464 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 
463 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.94 
 
 
476 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
458 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.87 
 
 
476 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
480 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  69.3 
 
 
530 aa  657    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.11 
 
 
464 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.64 
 
 
474 aa  680    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 
513 aa  638    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
464 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
461 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.73 
 
 
519 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.81 
 
 
465 aa  880    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
481 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
458 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
457 aa  658    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.48 
 
 
458 aa  652    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
463 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
463 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.56 
 
 
458 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 
463 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.79 
 
 
475 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 
464 aa  636    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.92 
 
 
517 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
458 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
460 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.36 
 
 
475 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
465 aa  945    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
458 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
464 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>