More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1681 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  74.68 
 
 		 518 aa  698    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.95 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  67.95 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 		 470 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 		 471 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 470 aa  659    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 472 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.57 
 
 		 475 aa  707    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.95 
 
 		 462 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.89 
 
 		 468 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0819  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.74 
 
 		 503 aa  651    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 		 465 aa  643    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.93 
 
 		 465 aa  644    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.48 
 
 		 521 aa  732    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  68.97 
 
 		 482 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 		 470 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 		 469 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 		 469 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 		 469 aa  665    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.56 
 
 		 517 aa  748    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 		 471 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 458 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  72.73 
 
 		 547 aa  689    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 468 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.15 
 
 		 477 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.57 
 
 		 465 aa  645    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  76.14 
 
 		 503 aa  695    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.25 
 
 		 507 aa  693    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.95 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.95 
 
 		 476 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.7 
 
 		 482 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.29 
 
 		 470 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.31 
 
 		 480 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.73 
 
 		 475 aa  735    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 		 468 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 		 468 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.94 
 
 		 484 aa  756    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 		 482 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 476 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 		 462 aa  659    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.13 
 
 		 464 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.25 
 
 		 470 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.24 
 
 		 470 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.25 
 
 		 471 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 		 469 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.92 
 
 		 468 aa  652    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 		 462 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.26 
 
 		 478 aa  727    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.73 
 
 		 475 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.43 
 
 		 484 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.69 
 
 		 474 aa  762    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.52 
 
 		 462 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.97 
 
 		 478 aa  744    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.83 
 
 		 482 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.04 
 
 		 471 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.28 
 
 		 476 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.8 
 
 		 481 aa  767    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 		 474 aa  655    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0573  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.02 
 
 		 507 aa  674    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.69 
 
 		 474 aa  716    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 474 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.52 
 
 		 537 aa  733    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.86 
 
 		 476 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 476 aa  959    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0327  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 467 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.713422  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 466 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.95 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.28 
 
 		 476 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  74.79 
 
 		 530 aa  717    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.86 
 
 		 476 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.15 
 
 		 477 aa  637    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.28 
 
 		 474 aa  734    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 470 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.05 
 
 		 474 aa  724    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.68 
 
 		 513 aa  763    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.48 
 
 		 521 aa  732    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 470 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.37 
 
 		 519 aa  753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.36 
 
 		 475 aa  741    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.14 
 
 		 465 aa  645    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 465 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 		 457 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 		 484 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.9 
 
 		 509 aa  726    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.49 
 
 		 464 aa  671    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 		 458 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 		 465 aa  643    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.12 
 
 		 467 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.35 
 
 		 479 aa  741    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.26 
 
 		 474 aa  721    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 		 474 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.79 
 
 		 469 aa  637    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 504 aa  642    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.83 
 
 		 475 aa  634    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 		 466 aa  639    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 		 468 aa  643    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.16 
 
 		 460 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 469 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.26 
 
 		 474 aa  718    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.16 
 
 		 481 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>