More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2452 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  68.04 
 
 		 518 aa  637    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 485 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.5 
 
 		 462 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.97 
 
 		 478 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 		 470 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 480 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 470 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.29 
 
 		 464 aa  676    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 476 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 		 470 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 		 468 aa  670    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 467 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1273  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.09 
 
 		 468 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 463 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 484 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 		 463 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.72 
 
 		 471 aa  670    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.03 
 
 		 469 aa  667    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.03 
 
 		 469 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 463 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.03 
 
 		 469 aa  667    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.76 
 
 		 478 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 		 475 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.05 
 
 		 458 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  68.24 
 
 		 547 aa  649    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  67.44 
 
 		 501 aa  636    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 		 464 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 		 462 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.03 
 
 		 470 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.49 
 
 		 458 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.96 
 
 		 458 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 476 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 482 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.93 
 
 		 475 aa  667    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 		 509 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.28 
 
 		 474 aa  651    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 		 475 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 		 468 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.36 
 
 		 468 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 467 aa  649    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.37 
 
 		 482 aa  676    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 		 462 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 		 470 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 470 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.5 
 
 		 462 aa  671    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.03 
 
 		 469 aa  667    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 472 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.54 
 
 		 476 aa  642    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 472 aa  650    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.62 
 
 		 462 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 482 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  69.43 
 
 		 503 aa  637    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 		 470 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 476 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 		 481 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 		 474 aa  641    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 474 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 476 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.55 
 
 		 475 aa  675    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.09 
 
 		 468 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 458 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.12 
 
 		 463 aa  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 476 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 484 aa  642    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 476 aa  634    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 		 468 aa  670    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.53 
 
 		 470 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 		 475 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.64 
 
 		 474 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.02 
 
 		 462 aa  684    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.53 
 
 		 470 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 513 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 463 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.51 
 
 		 519 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 465 aa  944    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  99.57 
 
 		 465 aa  941    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 463 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 493 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 463 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 463 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.16 
 
 		 472 aa  717    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 		 503 aa  664    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 476 aa  635    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 		 479 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.51 
 
 		 481 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 463 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.03 
 
 		 469 aa  645    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.07 
 
 		 504 aa  671    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 480 aa  650    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.68 
 
 		 466 aa  658    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.63 
 
 		 468 aa  662    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 		 472 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 469 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.37 
 
 		 462 aa  676    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 		 463 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  66.53 
 
 		 482 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.39 
 
 		 469 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 		 471 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 		 471 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>