More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54086 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  71.89 
 
 		 518 aa  709    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.63 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.49 
 
 		 470 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3652  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.07 
 
 		 478 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 465 aa  637    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 		 471 aa  672    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 		 475 aa  676    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.86 
 
 		 471 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 462 aa  660    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.5 
 
 		 470 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.07 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.46 
 
 		 521 aa  696    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.17 
 
 		 470 aa  692    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.22 
 
 		 465 aa  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.89 
 
 		 474 aa  704    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.7 
 
 		 471 aa  693    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.58 
 
 		 485 aa  705    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.05 
 
 		 484 aa  728    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 		 460 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  73.62 
 
 		 547 aa  719    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.79 
 
 		 462 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.05 
 
 		 460 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.32 
 
 		 480 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.73 
 
 		 473 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.35 
 
 		 507 aa  658    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1744  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.58 
 
 		 485 aa  705    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  0.184526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.74 
 
 		 476 aa  713    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.08 
 
 		 482 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.37 
 
 		 476 aa  718    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.07 
 
 		 465 aa  644    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.79 
 
 		 478 aa  709    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.42 
 
 		 475 aa  723    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.56 
 
 		 468 aa  668    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.56 
 
 		 468 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.79 
 
 		 484 aa  713    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.49 
 
 		 482 aa  658    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.47 
 
 		 460 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.49 
 
 		 462 aa  658    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  74.05 
 
 		 503 aa  689    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.86 
 
 		 470 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.01 
 
 		 470 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.07 
 
 		 462 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.74 
 
 		 484 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.29 
 
 		 484 aa  636    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.07 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 		 460 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.68 
 
 		 474 aa  706    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.47 
 
 		 462 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.47 
 
 		 460 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 		 482 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.3 
 
 		 470 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.11 
 
 		 476 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.96 
 
 		 481 aa  716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5168  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05631 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0573  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.55 
 
 		 507 aa  642    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.05 
 
 		 474 aa  693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 		 482 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.28 
 
 		 462 aa  657    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.89 
 
 		 476 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.42 
 
 		 483 aa  711    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.42 
 
 		 475 aa  723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.46 
 
 		 521 aa  696    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 		 472 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.89 
 
 		 476 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.05 
 
 		 493 aa  710    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.26 
 
 		 476 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 		 465 aa  643    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.74 
 
 		 474 aa  706    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.53 
 
 		 509 aa  714    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.21 
 
 		 478 aa  712    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.26 
 
 		 474 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.09 
 
 		 513 aa  704    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.95 
 
 		 517 aa  699    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.52 
 
 		 542 aa  711    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  76 
 
 		 519 aa  719    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.65 
 
 		 471 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.44 
 
 		 465 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.65 
 
 		 465 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.65 
 
 		 457 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.11 
 
 		 484 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.86 
 
 		 462 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.32 
 
 		 476 aa  707    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.47 
 
 		 460 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 		 460 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.42 
 
 		 467 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.02 
 
 		 479 aa  681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 		 472 aa  638    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  100 
 
 		 501 aa  1012    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.37 
 
 		 537 aa  713    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  75.82 
 
 		 530 aa  738    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.71 
 
 		 482 aa  707    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.42 
 
 		 481 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.5 
 
 		 464 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  76 
 
 		 475 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.48 
 
 		 469 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.02 
 
 		 474 aa  678    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>