More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119590 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  73.49 
 
 
518 aa  709    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 
460 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.23 
 
 
460 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.36 
 
 
470 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  68.62 
 
 
482 aa  662    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 
462 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.51 
 
 
460 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 
475 aa  683    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.26 
 
 
537 aa  731    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 
463 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.16 
 
 
461 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.3 
 
 
465 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.18 
 
 
521 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 
463 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.36 
 
 
478 aa  737    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.18 
 
 
521 aa  729    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.38 
 
 
480 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
471 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.09 
 
 
470 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.81 
 
 
458 aa  638    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.81 
 
 
458 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  69.04 
 
 
547 aa  702    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 
465 aa  659    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 
477 aa  651    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0819  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.8 
 
 
503 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
474 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 
476 aa  646    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.5 
 
 
507 aa  661    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 
459 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.3 
 
 
476 aa  748    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.62 
 
 
482 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
458 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.67 
 
 
481 aa  691    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
458 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.23 
 
 
475 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.46 
 
 
468 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.46 
 
 
468 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 
484 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.69 
 
 
482 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.52 
 
 
463 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.24 
 
 
462 aa  662    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
471 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.52 
 
 
470 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.58 
 
 
470 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 
464 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 
458 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 
468 aa  649    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.3 
 
 
465 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.52 
 
 
463 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.57 
 
 
509 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.56 
 
 
474 aa  736    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.03 
 
 
462 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
458 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.92 
 
 
482 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.45 
 
 
476 aa  742    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.42 
 
 
481 aa  726    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.29 
 
 
474 aa  650    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0573  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 
507 aa  647    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.89 
 
 
474 aa  718    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
474 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.54 
 
 
478 aa  764    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.02 
 
 
476 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 
460 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0327  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
467 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.713422  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.44 
 
 
517 aa  745    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 
463 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.66 
 
 
476 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
458 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.81 
 
 
476 aa  741    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 
477 aa  648    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
468 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.23 
 
 
475 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 
458 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.47 
 
 
474 aa  717    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.16 
 
 
513 aa  711    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.79 
 
 
476 aa  717    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.81 
 
 
461 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.66 
 
 
519 aa  742    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 
465 aa  655    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.23 
 
 
475 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  73.95 
 
 
503 aa  692    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
457 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.35 
 
 
484 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.38 
 
 
463 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.38 
 
 
463 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 
458 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 
460 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  100 
 
 
530 aa  1080    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.59 
 
 
479 aa  679    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.16 
 
 
484 aa  706    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 
458 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 
470 aa  675    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.11 
 
 
474 aa  717    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.59 
 
 
462 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.82 
 
 
475 aa  645    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
469 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.79 
 
 
474 aa  682    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 
463 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
465 aa  654    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.32 
 
 
471 aa  692    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>