More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0343 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  74.32 
 
 		 518 aa  693    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 		 460 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.94 
 
 		 460 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.38 
 
 		 470 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 		 464 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 		 474 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.37 
 
 		 460 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.65 
 
 		 475 aa  689    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 		 460 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.95 
 
 		 478 aa  844    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 460 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.77 
 
 		 465 aa  660    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.81 
 
 		 521 aa  779    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 463 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  75.05 
 
 		 503 aa  684    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 		 463 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.69 
 
 		 475 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.89 
 
 		 480 aa  839    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 464 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.51 
 
 		 478 aa  808    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 		 460 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  70.92 
 
 		 547 aa  671    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 459 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 463 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.89 
 
 		 517 aa  791    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.21 
 
 		 462 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  68.45 
 
 		 482 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.29 
 
 		 507 aa  676    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.66 
 
 		 481 aa  685    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.23 
 
 		 476 aa  808    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.7 
 
 		 482 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 464 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 		 458 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 		 465 aa  661    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.9 
 
 		 475 aa  739    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.08 
 
 		 468 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.08 
 
 		 468 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 464 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 		 482 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.26 
 
 		 474 aa  739    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.81 
 
 		 521 aa  779    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.51 
 
 		 460 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.17 
 
 		 470 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.81 
 
 		 470 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.77 
 
 		 465 aa  660    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 458 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 		 468 aa  651    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.61 
 
 		 509 aa  800    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.26 
 
 		 465 aa  650    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 		 465 aa  663    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.27 
 
 		 474 aa  734    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.79 
 
 		 462 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 464 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 		 482 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.33 
 
 		 476 aa  797    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.43 
 
 		 481 aa  747    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 		 474 aa  648    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0573  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.24 
 
 		 507 aa  661    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.74 
 
 		 474 aa  724    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.64 
 
 		 474 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 		 458 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.91 
 
 		 476 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.65 
 
 		 465 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.77 
 
 		 484 aa  659    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 		 464 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 463 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.12 
 
 		 476 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  75.68 
 
 		 530 aa  730    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.33 
 
 		 476 aa  804    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.9 
 
 		 475 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 467 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 464 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.58 
 
 		 468 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.37 
 
 		 474 aa  738    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.59 
 
 		 513 aa  733    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 463 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.41 
 
 		 519 aa  811    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.48 
 
 		 470 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 464 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 464 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 457 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 464 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 463 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 463 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 		 483 aa  639    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 		 463 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.74 
 
 		 476 aa  719    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.09 
 
 		 479 aa  739    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.53 
 
 		 484 aa  730    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.27 
 
 		 471 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.09 
 
 		 537 aa  816    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.48 
 
 		 471 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.4 
 
 		 470 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 		 476 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 464 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.83 
 
 		 469 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.71 
 
 		 474 aa  670    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 		 463 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>