More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2382 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 470 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 470 aa  668    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.06 
 
 		 475 aa  676    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  65.6 
 
 		 471 aa  639    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 		 471 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 		 474 aa  661    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  66.67 
 
 		 547 aa  640    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 470 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 471 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.79 
 
 		 465 aa  668    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.92 
 
 		 482 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 458 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 		 468 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 		 468 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  68.38 
 
 		 465 aa  641    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 		 482 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 462 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 		 462 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.17 
 
 		 471 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.37 
 
 		 470 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.74 
 
 		 472 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 		 464 aa  671    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 		 472 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.29 
 
 		 462 aa  715    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.1 
 
 		 459 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 		 472 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 		 465 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  68.13 
 
 		 487 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 		 470 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.58 
 
 		 475 aa  660    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  66.31 
 
 		 468 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.17 
 
 		 462 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 465 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 465 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 		 467 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 476 aa  972    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 462 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 		 474 aa  636    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.42 
 
 		 475 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.75 
 
 		 460 aa  631  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.1 
 
 		 462 aa  633  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  67.24 
 
 		 503 aa  634  1e-180  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 458 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 458 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3511  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.87 
 
 		 468 aa  631  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.42 
 
 		 475 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.05 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.6 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3203  ATP synthase F1, beta subunit  65.25 
 
 		 469 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.25 
 
 		 471 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.03 
 
 		 481 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.42 
 
 		 475 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2807  ATP synthase F1, beta subunit  65.25 
 
 		 469 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.339111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.74 
 
 		 476 aa  631  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 		 474 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.27 
 
 		 493 aa  631  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.83 
 
 		 476 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  65.13 
 
 		 482 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.76 
 
 		 458 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  65.18 
 
 		 458 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.03 
 
 		 484 aa  630  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 458 aa  627  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 		 473 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  64.71 
 
 		 530 aa  628  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.84 
 
 		 474 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.76 
 
 		 458 aa  624  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 475 aa  625  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.35 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52160  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.12 
 
 		 458 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  65.38 
 
 		 462 aa  626  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 		 459 aa  625  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 		 481 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 		 473 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.25 
 
 		 473 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 		 458 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 464 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 		 519 aa  627  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.18 
 
 		 457 aa  627  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.35 
 
 		 476 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.18 
 
 		 458 aa  625  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.76 
 
 		 458 aa  624  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5431  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.54 
 
 		 458 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.33 
 
 		 458 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.25 
 
 		 459 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.03 
 
 		 480 aa  621  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.54 
 
 		 465 aa  624  1e-177  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.54 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.97 
 
 		 469 aa  621  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 		 460 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.11 
 
 		 462 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.1 
 
 		 462 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.56 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>