More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1265 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.15 
 
 
471 aa  754    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  97.45 
 
 
471 aa  925    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
471 aa  944    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  70.7 
 
 
471 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.22 
 
 
471 aa  801    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  69.37 
 
 
465 aa  635    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.1 
 
 
467 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.61 
 
 
472 aa  627  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  67.68 
 
 
470 aa  626  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.3 
 
 
462 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.53 
 
 
465 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.87 
 
 
465 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  67.32 
 
 
467 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  65.07 
 
 
487 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 
474 aa  618  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.87 
 
 
482 aa  617  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.08 
 
 
458 aa  618  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.6 
 
 
476 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  66.23 
 
 
464 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.43 
 
 
459 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.78 
 
 
475 aa  613  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.78 
 
 
472 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.32 
 
 
482 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.59 
 
 
468 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.59 
 
 
468 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.78 
 
 
462 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 
463 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.65 
 
 
462 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
475 aa  612  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.07 
 
 
463 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1522  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.22 
 
 
484 aa  609  1e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000415981  hitchhiker  2.83591e-17 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.43 
 
 
462 aa  609  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 
463 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3993  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.64 
 
 
460 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0485  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.8 
 
 
466 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.22 
 
 
462 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 
463 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0424  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.8 
 
 
466 aa  610  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.69 
 
 
465 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.88 
 
 
519 aa  608  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 
463 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 
463 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.01 
 
 
462 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.96 
 
 
466 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.23 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0022  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.74 
 
 
466 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0274087  hitchhiker  0.000479158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.44 
 
 
463 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.66 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4194  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 
460 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.44 
 
 
463 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.44 
 
 
463 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.66 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.78 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.34 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.66 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2528  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.07 
 
 
467 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.18 
 
 
474 aa  604  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 
464 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.66 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.44 
 
 
463 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.82 
 
 
473 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.34 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.66 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.45 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  62.91 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.19 
 
 
458 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.66 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.66 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.6 
 
 
464 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.21 
 
 
471 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002030  ATP synthase beta chain  63.64 
 
 
467 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  64.19 
 
 
485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 
473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.54 
 
 
471 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0122  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.23 
 
 
464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.66 
 
 
459 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.21 
 
 
458 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.35 
 
 
462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.23 
 
 
464 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  63.38 
 
 
481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0506  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.47 
 
 
473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.452811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4547  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.99 
 
 
460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  63.89 
 
 
482 aa  603  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.69 
 
 
471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.15 
 
 
484 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.66 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.23 
 
 
464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.81 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.56 
 
 
457 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.23 
 
 
464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.77 
 
 
460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.23 
 
 
464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00421  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.99 
 
 
467 aa  598  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4114  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.09 
 
 
466 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.181857  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.99 
 
 
484 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.91 
 
 
458 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.45 
 
 
503 aa  600  1e-170  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.41 
 
 
458 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
468 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>