More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1804 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
439 aa  902    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  77.93 
 
 
440 aa  711    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  46.8 
 
 
443 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  49.13 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  47.03 
 
 
438 aa  395  1e-109  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  43.84 
 
 
434 aa  392  1e-108  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  48.63 
 
 
452 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  44.5 
 
 
431 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  39.23 
 
 
460 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  40.76 
 
 
455 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  39.19 
 
 
466 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  35.93 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.14 
 
 
466 aa  265  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  38.66 
 
 
460 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  37.1 
 
 
472 aa  263  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  35.64 
 
 
474 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.61 
 
 
466 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  37.22 
 
 
462 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  38.36 
 
 
459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  37.41 
 
 
463 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  38.62 
 
 
461 aa  259  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.39 
 
 
472 aa  259  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  38.43 
 
 
464 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  37.88 
 
 
460 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  37.88 
 
 
460 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  36.14 
 
 
460 aa  256  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
462 aa  256  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.92 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  37.28 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  36.28 
 
 
462 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.69 
 
 
459 aa  254  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.89 
 
 
459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  36.04 
 
 
462 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  36.21 
 
 
462 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  36.64 
 
 
460 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  37.89 
 
 
470 aa  250  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  36.83 
 
 
471 aa  249  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  36.24 
 
 
460 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  35.03 
 
 
464 aa  248  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  35.39 
 
 
515 aa  246  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  35.24 
 
 
505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  36.41 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  36.41 
 
 
454 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  35.46 
 
 
463 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  35.31 
 
 
469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  35.92 
 
 
461 aa  240  4e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  35.29 
 
 
508 aa  239  9e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  36.02 
 
 
466 aa  238  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  38.1 
 
 
479 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  35.16 
 
 
467 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  35.99 
 
 
477 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  35.31 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  35.09 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  34.73 
 
 
507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  34.7 
 
 
467 aa  234  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  34.47 
 
 
467 aa  233  5e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  34.27 
 
 
506 aa  233  6e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.14 
 
 
466 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  33.98 
 
 
460 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  38.36 
 
 
440 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  35.64 
 
 
477 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  35.24 
 
 
461 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  33.64 
 
 
475 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  34.88 
 
 
477 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  28.89 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  30 
 
 
445 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  29.71 
 
 
445 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  28.53 
 
 
435 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  28.24 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  29.71 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  26.8 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  27.01 
 
 
427 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  26.63 
 
 
438 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  26.97 
 
 
437 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  26.93 
 
 
440 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  27.2 
 
 
443 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  26.46 
 
 
437 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  27.14 
 
 
440 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  27.38 
 
 
436 aa  99.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  27.56 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  25.72 
 
 
436 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  25 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  26.21 
 
 
439 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  26.32 
 
 
501 aa  97.1  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  26.45 
 
 
502 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  24.79 
 
 
439 aa  96.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  27.65 
 
 
460 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  26.39 
 
 
505 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  27.33 
 
 
466 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  26.45 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  28.9 
 
 
465 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  25.68 
 
 
503 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  27.02 
 
 
505 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  29.11 
 
 
442 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  26.2 
 
 
438 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3099  ATP synthase SpaL  25.36 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0585331  hitchhiker  0.00000194741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3204  ATP synthase SpaL  25.36 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>