More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0257 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  72.09 
 
 
455 aa  707    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  72.81 
 
 
460 aa  688    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  75.93 
 
 
459 aa  729    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  71.02 
 
 
472 aa  677    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  80.4 
 
 
460 aa  770    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  80.4 
 
 
460 aa  770    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 
459 aa  929    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  75.66 
 
 
460 aa  713    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  63.97 
 
 
460 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  63 
 
 
462 aa  615  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  62.56 
 
 
462 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  62.33 
 
 
462 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  62.11 
 
 
462 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  60.67 
 
 
464 aa  592  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  62.47 
 
 
459 aa  592  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  59.11 
 
 
466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  58.42 
 
 
469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  60.26 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  59.44 
 
 
474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  60.22 
 
 
462 aa  569  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  59.6 
 
 
460 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  59.48 
 
 
471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  59.56 
 
 
461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  60 
 
 
472 aa  558  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  59.96 
 
 
471 aa  558  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  59.57 
 
 
471 aa  560  1e-158  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  58.72 
 
 
460 aa  555  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  58.77 
 
 
463 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  58.41 
 
 
463 aa  551  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.37 
 
 
466 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.15 
 
 
466 aa  551  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  58.72 
 
 
458 aa  548  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  58.19 
 
 
460 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  56.17 
 
 
461 aa  545  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  58.24 
 
 
460 aa  541  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  58.63 
 
 
466 aa  544  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  56.48 
 
 
470 aa  531  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  54.37 
 
 
508 aa  528  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  55.85 
 
 
463 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  53.58 
 
 
507 aa  522  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  56.61 
 
 
472 aa  524  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  55.34 
 
 
461 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  52.26 
 
 
515 aa  521  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  53.36 
 
 
506 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  51.91 
 
 
505 aa  512  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  54.17 
 
 
467 aa  512  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  54.39 
 
 
467 aa  512  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  54.17 
 
 
467 aa  511  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  54.42 
 
 
477 aa  509  1e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  54.17 
 
 
467 aa  511  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.2 
 
 
455 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  51.66 
 
 
479 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  52.33 
 
 
460 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  53.14 
 
 
475 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  50 
 
 
454 aa  472  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  53.29 
 
 
477 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  53.14 
 
 
477 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  48.96 
 
 
440 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.49 
 
 
466 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  39.38 
 
 
438 aa  290  3e-77  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  36.74 
 
 
458 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
452 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  38.16 
 
 
431 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  38.02 
 
 
443 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.73 
 
 
434 aa  273  3e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  38.3 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  35.89 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  32.31 
 
 
427 aa  170  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  31.91 
 
 
442 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  32.03 
 
 
438 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.87 
 
 
437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  30.24 
 
 
439 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  30.83 
 
 
434 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  30.89 
 
 
435 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  34.2 
 
 
443 aa  156  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  30.87 
 
 
442 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  32.46 
 
 
449 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  33.91 
 
 
434 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  32.46 
 
 
443 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  32.46 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  31.88 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  32.37 
 
 
434 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  29.08 
 
 
437 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  32.18 
 
 
436 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  32.33 
 
 
435 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  31.85 
 
 
440 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  29.63 
 
 
431 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  30.48 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  30.57 
 
 
451 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  31.8 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  33.24 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  28.97 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  32.18 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  32.02 
 
 
435 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  30.73 
 
 
461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  30.73 
 
 
461 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  29.87 
 
 
463 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  30.73 
 
 
462 aa  146  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  30.73 
 
 
458 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  29.29 
 
 
442 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>