More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3441 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
461 aa  941    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  62.42 
 
 
463 aa  607  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  57.3 
 
 
460 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  57.39 
 
 
454 aa  551  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  57.49 
 
 
460 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  57.49 
 
 
460 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  55.85 
 
 
461 aa  548  1e-155  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.98 
 
 
455 aa  549  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  57.39 
 
 
463 aa  545  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.99 
 
 
459 aa  547  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  55.95 
 
 
455 aa  546  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  56.3 
 
 
466 aa  538  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  54.77 
 
 
469 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  54.19 
 
 
464 aa  532  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  56.09 
 
 
459 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.77 
 
 
472 aa  529  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  54.05 
 
 
460 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  54.15 
 
 
460 aa  528  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  54.05 
 
 
462 aa  527  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.34 
 
 
459 aa  523  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  54.7 
 
 
515 aa  521  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  52.95 
 
 
462 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  52.95 
 
 
462 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  52.74 
 
 
462 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  53.9 
 
 
506 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  54.13 
 
 
508 aa  513  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  53.91 
 
 
460 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.59 
 
 
466 aa  511  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  53.19 
 
 
460 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  54.08 
 
 
479 aa  508  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  52.85 
 
 
460 aa  508  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  52.86 
 
 
462 aa  511  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  54.08 
 
 
472 aa  508  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  51.82 
 
 
507 aa  508  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  54.51 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  52.43 
 
 
464 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  52.54 
 
 
505 aa  503  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.7 
 
 
466 aa  501  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  52.17 
 
 
461 aa  501  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  52.49 
 
 
471 aa  495  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  51.1 
 
 
460 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  52.1 
 
 
458 aa  495  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  52.51 
 
 
472 aa  497  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  52.51 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  52.29 
 
 
474 aa  488  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  51.42 
 
 
463 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  52.09 
 
 
471 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  51.87 
 
 
471 aa  485  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  52.32 
 
 
467 aa  483  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  52.54 
 
 
467 aa  482  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  52.1 
 
 
467 aa  481  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  51.63 
 
 
467 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  51.33 
 
 
477 aa  472  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  50.79 
 
 
460 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  49.66 
 
 
477 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  50 
 
 
477 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  49.22 
 
 
475 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.97 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  45.01 
 
 
440 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  38.44 
 
 
458 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  37.62 
 
 
452 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  36.56 
 
 
438 aa  264  2e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.46 
 
 
431 aa  265  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.15 
 
 
443 aa  263  6e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  36.68 
 
 
434 aa  257  3e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  38.23 
 
 
440 aa  238  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  35.24 
 
 
439 aa  225  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.16 
 
 
427 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  29.62 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  29.1 
 
 
437 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  33.12 
 
 
437 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30.79 
 
 
443 aa  156  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  36.27 
 
 
436 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  33.68 
 
 
439 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  30.69 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  33.68 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  31.01 
 
 
442 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  34.55 
 
 
439 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  30.33 
 
 
444 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  32.68 
 
 
439 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  32.35 
 
 
437 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  29.38 
 
 
464 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1482  flagellum-specific ATP synthase  29.6 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  30.53 
 
 
438 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  30.25 
 
 
480 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  33.33 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  30.26 
 
 
444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  29.34 
 
 
434 aa  147  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1695  flagellum-specific ATP synthase  29.13 
 
 
434 aa  147  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  32.93 
 
 
440 aa  146  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0130  ATP synthase F1, beta subunit  30.11 
 
 
465 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  28.89 
 
 
442 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  30.33 
 
 
440 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  32.09 
 
 
438 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  34.19 
 
 
437 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  34.29 
 
 
460 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  32.25 
 
 
439 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.4 
 
 
466 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  27.48 
 
 
463 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  33.91 
 
 
440 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>