More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1682 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
431 aa  886    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  74.59 
 
 
434 aa  674    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  67.6 
 
 
443 aa  632  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  58.54 
 
 
452 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  58.77 
 
 
458 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  57.41 
 
 
438 aa  512  1e-144  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.13 
 
 
440 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  44.5 
 
 
439 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  39.04 
 
 
460 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  37.91 
 
 
460 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  37.91 
 
 
460 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  39.13 
 
 
471 aa  289  8e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  39.69 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  38.21 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  38.56 
 
 
474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.16 
 
 
459 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  38.51 
 
 
460 aa  282  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  37.88 
 
 
459 aa  282  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.26 
 
 
459 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  37.53 
 
 
455 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  38.34 
 
 
460 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  38.78 
 
 
472 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.86 
 
 
472 aa  279  9e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  39.21 
 
 
463 aa  278  1e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  39.12 
 
 
471 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  37.97 
 
 
461 aa  276  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  36.78 
 
 
462 aa  275  9e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  37.92 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  37.23 
 
 
471 aa  272  9e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  36.92 
 
 
469 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  36.32 
 
 
460 aa  270  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  37 
 
 
464 aa  270  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  36.56 
 
 
462 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  36.12 
 
 
462 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  36.34 
 
 
462 aa  269  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  36.48 
 
 
461 aa  269  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  36.26 
 
 
464 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  36.48 
 
 
462 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.52 
 
 
466 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  35.88 
 
 
505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.92 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  36.32 
 
 
463 aa  266  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  36.78 
 
 
460 aa  266  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  38.18 
 
 
463 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  35.82 
 
 
460 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  36.46 
 
 
461 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  35.94 
 
 
515 aa  263  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  36.15 
 
 
470 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  36.4 
 
 
458 aa  260  4e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  35.32 
 
 
467 aa  259  9e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  35.54 
 
 
467 aa  257  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  36.78 
 
 
454 aa  256  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  35.79 
 
 
472 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  35.13 
 
 
508 aa  252  7e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  36.3 
 
 
506 aa  252  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  34.22 
 
 
467 aa  251  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  35.38 
 
 
477 aa  250  4e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  37.07 
 
 
460 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.16 
 
 
466 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.34 
 
 
455 aa  246  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  35.8 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  34.92 
 
 
507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  36.59 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  38.29 
 
 
440 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  35.32 
 
 
475 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  35.32 
 
 
477 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  29.54 
 
 
440 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  28.85 
 
 
443 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  28.37 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  29.04 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  27.72 
 
 
438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  27.64 
 
 
438 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  28.46 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  28.46 
 
 
452 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  27.84 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  29.03 
 
 
439 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  26.42 
 
 
438 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  25.48 
 
 
436 aa  123  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  27.51 
 
 
446 aa  123  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  28.53 
 
 
445 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  28.21 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  27.01 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  29.97 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  27.01 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  26.63 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  28.01 
 
 
431 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  28 
 
 
436 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  26.78 
 
 
437 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  27.1 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  26.58 
 
 
435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  27.72 
 
 
437 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  27.95 
 
 
454 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  26.15 
 
 
427 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  27.5 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0120  flagellum-specific ATP synthase  29.13 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  28.21 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  27.01 
 
 
451 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  31.14 
 
 
446 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  28.06 
 
 
443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>