More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2762 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
477 aa  931    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  96.65 
 
 
475 aa  884    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  98.32 
 
 
477 aa  914    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  84.35 
 
 
460 aa  758    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  58.77 
 
 
466 aa  531  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.32 
 
 
466 aa  521  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.76 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  56.73 
 
 
470 aa  511  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  56.05 
 
 
462 aa  504  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  55.48 
 
 
462 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  54.81 
 
 
464 aa  499  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  55.26 
 
 
462 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  55.26 
 
 
462 aa  498  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  55.91 
 
 
462 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.97 
 
 
472 aa  497  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  54.61 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.6 
 
 
459 aa  491  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  55.83 
 
 
459 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  55.67 
 
 
464 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  52.86 
 
 
460 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  52.86 
 
 
460 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  55.38 
 
 
461 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  53.96 
 
 
463 aa  482  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  55.03 
 
 
460 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.14 
 
 
459 aa  475  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  54.59 
 
 
460 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  54.03 
 
 
469 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  54.71 
 
 
460 aa  472  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  54.07 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  54.71 
 
 
458 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  54.63 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  51.35 
 
 
455 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  53.09 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  53.63 
 
 
460 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  54.51 
 
 
474 aa  464  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  53.3 
 
 
471 aa  458  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  52.02 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  50.21 
 
 
505 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  52.76 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  52.77 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  50 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  50.44 
 
 
463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  49.01 
 
 
461 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  49.56 
 
 
463 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  50.11 
 
 
506 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  52.7 
 
 
440 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  50.9 
 
 
460 aa  435  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  50.78 
 
 
479 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  50 
 
 
508 aa  434  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  50.34 
 
 
466 aa  434  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.22 
 
 
455 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  51.24 
 
 
467 aa  427  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  47.58 
 
 
515 aa  424  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  51.47 
 
 
467 aa  424  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  51.47 
 
 
467 aa  423  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  50.79 
 
 
467 aa  422  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  51.46 
 
 
477 aa  414  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  46.32 
 
 
454 aa  391  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.79 
 
 
466 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  38.11 
 
 
452 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.84 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.61 
 
 
434 aa  247  4e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  35.32 
 
 
431 aa  242  9e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.01 
 
 
443 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  35.75 
 
 
440 aa  239  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
438 aa  232  1e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  35.28 
 
 
439 aa  223  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  34.35 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  31.81 
 
 
427 aa  166  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  36.73 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.81 
 
 
438 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  32.64 
 
 
446 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  31.7 
 
 
439 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  33.72 
 
 
446 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  30.73 
 
 
480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  34.3 
 
 
460 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  35.57 
 
 
435 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  34.72 
 
 
439 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  32.86 
 
 
446 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  31.27 
 
 
452 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  30.29 
 
 
437 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  34.14 
 
 
439 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  31.79 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  31.79 
 
 
439 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  33.14 
 
 
446 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  32.69 
 
 
446 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  35.34 
 
 
435 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  33.85 
 
 
439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  30.81 
 
 
440 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  36.44 
 
 
434 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  32.37 
 
 
451 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  32.39 
 
 
440 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  32.87 
 
 
463 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.34 
 
 
437 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  31.52 
 
 
439 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  34.11 
 
 
439 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  32.47 
 
 
446 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  32.29 
 
 
446 aa  150  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  33.05 
 
 
444 aa  150  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  34.81 
 
 
470 aa  149  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>