More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2344 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  67.11 
 
 		 462 aa  638    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 462 aa  939    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  88.26 
 
 		 461 aa  842    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  67.33 
 
 		 462 aa  636    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  69 
 
 		 471 aa  647    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  77.07 
 
 		 460 aa  738    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  92.44 
 
 		 464 aa  875    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  66.89 
 
 		 462 aa  635    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  67.69 
 
 		 464 aa  651    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  67.83 
 
 		 474 aa  644    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  67.33 
 
 		 462 aa  638    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  86.3 
 
 		 460 aa  823    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  78.54 
 
 		 460 aa  748    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  83.81 
 
 		 458 aa  791    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  75.49 
 
 		 463 aa  720    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  71.05 
 
 		 471 aa  662    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  69.3 
 
 		 471 aa  650    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  71.52 
 
 		 472 aa  672    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  66.89 
 
 		 459 aa  622  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  63.5 
 
 		 472 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  64.33 
 
 		 466 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  63.08 
 
 		 459 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  63.08 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  63.22 
 
 		 466 aa  589  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  62.56 
 
 		 466 aa  589  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  60.79 
 
 		 460 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  60.79 
 
 		 460 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  60.4 
 
 		 455 aa  579  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  62.83 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  61.37 
 
 		 469 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.22 
 
 		 459 aa  569  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  59.69 
 
 		 460 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  59.15 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  58.37 
 
 		 460 aa  558  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  56.64 
 
 		 463 aa  548  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  57.24 
 
 		 472 aa  541  1e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  56.76 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  56.22 
 
 		 506 aa  539  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  56.21 
 
 		 508 aa  538  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  57.11 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  54.03 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  54.45 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  56.7 
 
 		 460 aa  521  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  55.8 
 
 		 466 aa  525  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.79 
 
 		 455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  52.86 
 
 		 461 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  55.11 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  54.44 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  54.67 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  54.67 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  57.79 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  52.81 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  53.42 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  56.83 
 
 		 475 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  56.61 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  57.02 
 
 		 477 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  51.22 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  52.86 
 
 		 440 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.58 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  39.08 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  39.3 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.63 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  36.64 
 
 		 443 aa  274  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  36.48 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.48 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  37.22 
 
 		 439 aa  260  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  37.14 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  31.38 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.38 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.47 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  32.64 
 
 		 443 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  29.59 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  31.68 
 
 		 431 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  29.23 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  31.35 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  31.93 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  29.45 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  29.43 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  28.14 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  30.5 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  27.08 
 
 		 439 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  31.38 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  29.16 
 
 		 444 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  29.69 
 
 		 443 aa  153  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  30.92 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  29.55 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  28.91 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  30.67 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  27.88 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  29.05 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1777  flagellum-specific ATP synthase  31.46 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  30.68 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.03 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  30.53 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  29.66 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  30.93 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  28.97 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  28.47 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  30.7 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  30.05 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>