More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0282 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  67.83 
 
 
462 aa  647    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  68.91 
 
 
464 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  87.5 
 
 
471 aa  795    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  80.17 
 
 
471 aa  752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  66.3 
 
 
460 aa  636    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  86.44 
 
 
472 aa  806    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  86.21 
 
 
471 aa  789    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  68.91 
 
 
461 aa  655    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
474 aa  953    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  65.94 
 
 
458 aa  634  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  66.45 
 
 
463 aa  628  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  65.43 
 
 
460 aa  626  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  65.8 
 
 
460 aa  622  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  64.85 
 
 
459 aa  605  9.999999999999999e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  61.74 
 
 
460 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  61.74 
 
 
460 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  62.2 
 
 
459 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  61 
 
 
464 aa  588  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  62.01 
 
 
462 aa  588  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.78 
 
 
472 aa  585  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  59.57 
 
 
455 aa  585  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  61.35 
 
 
462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  61.35 
 
 
462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  60.87 
 
 
460 aa  579  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  61.14 
 
 
462 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.87 
 
 
459 aa  578  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  60.43 
 
 
460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  61.57 
 
 
466 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.75 
 
 
466 aa  568  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.53 
 
 
466 aa  565  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  57.3 
 
 
460 aa  565  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  58.79 
 
 
469 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  60.22 
 
 
470 aa  555  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  56.22 
 
 
463 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  54.55 
 
 
515 aa  535  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  55.12 
 
 
508 aa  538  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  55.75 
 
 
463 aa  533  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  56.06 
 
 
461 aa  535  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  54.91 
 
 
505 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  54.9 
 
 
506 aa  534  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  55.75 
 
 
466 aa  529  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  54.66 
 
 
507 aa  526  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  55.51 
 
 
460 aa  526  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  54.47 
 
 
472 aa  512  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  53.7 
 
 
467 aa  504  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  53.04 
 
 
467 aa  503  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  53.26 
 
 
467 aa  503  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  53.26 
 
 
467 aa  504  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  53.35 
 
 
477 aa  496  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  50.96 
 
 
479 aa  495  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  52.72 
 
 
461 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  54.41 
 
 
460 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.11 
 
 
455 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  54.63 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  54.99 
 
 
477 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  54.41 
 
 
475 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  48.15 
 
 
454 aa  455  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  49.55 
 
 
440 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.16 
 
 
466 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  37.37 
 
 
452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
458 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.73 
 
 
438 aa  287  2e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  38.56 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  39.18 
 
 
443 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  36.27 
 
 
434 aa  277  3e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  35.85 
 
 
439 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  35.64 
 
 
440 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  29.33 
 
 
427 aa  171  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  29.33 
 
 
438 aa  169  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  31.75 
 
 
434 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  32.06 
 
 
443 aa  166  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  30.66 
 
 
437 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  31.56 
 
 
480 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  31.44 
 
 
434 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  29.22 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  30.21 
 
 
437 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  30.02 
 
 
435 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  31.55 
 
 
465 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  29.43 
 
 
442 aa  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  29.55 
 
 
431 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  30.29 
 
 
440 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  30.47 
 
 
449 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  31.34 
 
 
439 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  30.47 
 
 
443 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  29.66 
 
 
437 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  30.47 
 
 
449 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  29.6 
 
 
438 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  31.07 
 
 
440 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  28.22 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  30.51 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  29.77 
 
 
443 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  33.86 
 
 
460 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  30.06 
 
 
452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  29.33 
 
 
444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  28.89 
 
 
438 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  30.06 
 
 
452 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  28.38 
 
 
442 aa  146  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  26.81 
 
 
429 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  30 
 
 
446 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  29.48 
 
 
437 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>