More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0288 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  70.88 
 
 		 472 aa  675    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  88.26 
 
 		 462 aa  842    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  76.81 
 
 		 460 aa  738    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  83.41 
 
 		 458 aa  796    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  68.21 
 
 		 462 aa  636    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  69.74 
 
 		 471 aa  655    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  67.32 
 
 		 464 aa  642    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  71.93 
 
 		 471 aa  668    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  68.7 
 
 		 474 aa  651    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  87.17 
 
 		 460 aa  825    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 461 aa  933    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  78.07 
 
 		 460 aa  748    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  77.34 
 
 		 463 aa  730    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  88.18 
 
 		 464 aa  839    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  71.18 
 
 		 471 aa  664    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  67.33 
 
 		 462 aa  631  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  67.77 
 
 		 462 aa  633  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  67.55 
 
 		 462 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  66.45 
 
 		 459 aa  615  1e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  65.78 
 
 		 466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  63.46 
 
 		 466 aa  594  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  63.86 
 
 		 472 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  63.46 
 
 		 466 aa  594  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  62.2 
 
 		 460 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  62.64 
 
 		 459 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  62.83 
 
 		 470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  60.79 
 
 		 460 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  60.79 
 
 		 460 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  61.59 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  60.18 
 
 		 455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  60.13 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  58.72 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  60.44 
 
 		 472 aa  565  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.56 
 
 		 459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  59.47 
 
 		 460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  58.19 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  56.87 
 
 		 506 aa  550  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  57.3 
 
 		 508 aa  549  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  58.39 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  55.89 
 
 		 515 aa  542  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  55.27 
 
 		 507 aa  534  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  56.43 
 
 		 466 aa  531  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  56.32 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  55.63 
 
 		 467 aa  518  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  55.85 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  55.19 
 
 		 467 aa  518  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  56.29 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  55.82 
 
 		 460 aa  514  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  54.75 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.98 
 
 		 455 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  54.42 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  52.17 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  57.34 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  55.51 
 
 		 477 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  55.73 
 
 		 475 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  52.99 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  55.9 
 
 		 477 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  53.78 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.17 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.77 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  37.55 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  36.92 
 
 		 434 aa  282  8.000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  37.2 
 
 		 443 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.77 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.48 
 
 		 431 aa  269  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  38.62 
 
 		 439 aa  259  7e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  36.14 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  32.85 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  32.85 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.72 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30.75 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  30.71 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  31.19 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  33.51 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  30.93 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  29.71 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  30.61 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  29.4 
 
 		 442 aa  156  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  28.64 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  32.11 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  29.95 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  31.73 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  31.49 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  31.51 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  29.95 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  31.38 
 
 		 442 aa  153  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  29.43 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  30.23 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  29.92 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  32.38 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  31.43 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  30.81 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  31.1 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  30.93 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  29.58 
 
 		 449 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  31.64 
 
 		 449 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  30.96 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  29.58 
 
 		 443 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  28.9 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  29.58 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>