More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2082 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
479 aa  978    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  54.85 
 
 
464 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.64 
 
 
459 aa  540  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.36 
 
 
455 aa  535  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  56.58 
 
 
463 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  54.8 
 
 
459 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  56.43 
 
 
460 aa  529  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  54.55 
 
 
463 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  55.63 
 
 
462 aa  527  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  55.41 
 
 
462 aa  527  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  55.63 
 
 
462 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  54.32 
 
 
455 aa  525  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.07 
 
 
472 aa  522  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  54.97 
 
 
462 aa  521  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  53.22 
 
 
469 aa  520  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  53.32 
 
 
463 aa  514  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  53.41 
 
 
466 aa  511  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  52.99 
 
 
460 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  52.99 
 
 
460 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.03 
 
 
466 aa  514  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.6 
 
 
466 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  54.27 
 
 
460 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  54.08 
 
 
461 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  53.38 
 
 
460 aa  508  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  54.42 
 
 
464 aa  511  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  53.22 
 
 
460 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  54.42 
 
 
461 aa  504  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.66 
 
 
459 aa  504  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  53.54 
 
 
460 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  55.56 
 
 
466 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  52.86 
 
 
461 aa  504  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  52.21 
 
 
460 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  52.98 
 
 
458 aa  498  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  52.81 
 
 
462 aa  501  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  53.02 
 
 
470 aa  498  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  51.11 
 
 
460 aa  495  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  52.99 
 
 
472 aa  495  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  53.54 
 
 
472 aa  491  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  52.13 
 
 
471 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  50.75 
 
 
474 aa  491  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  53.08 
 
 
471 aa  487  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  50.54 
 
 
508 aa  484  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  51.33 
 
 
454 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  49.78 
 
 
515 aa  479  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  48.73 
 
 
506 aa  478  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  50.43 
 
 
505 aa  478  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  51.52 
 
 
471 aa  479  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  47.51 
 
 
507 aa  477  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  50.55 
 
 
477 aa  463  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  51 
 
 
467 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  51 
 
 
467 aa  457  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  50.78 
 
 
467 aa  458  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  50.55 
 
 
467 aa  457  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  52.1 
 
 
460 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  50.78 
 
 
477 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  50.55 
 
 
477 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  50.55 
 
 
475 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  50.11 
 
 
440 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  46 
 
 
466 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  39.76 
 
 
458 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  39.42 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  39.29 
 
 
438 aa  258  1e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  37.56 
 
 
440 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  38.59 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.59 
 
 
431 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  38.1 
 
 
439 aa  239  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  35.24 
 
 
434 aa  227  4e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  31.42 
 
 
463 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  32.04 
 
 
458 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  32.96 
 
 
438 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.35 
 
 
427 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  34.73 
 
 
449 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  32.9 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  35.4 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  30.43 
 
 
439 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  32.9 
 
 
439 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  29.98 
 
 
438 aa  156  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  34.16 
 
 
472 aa  156  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  31.49 
 
 
435 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1777  flagellum-specific ATP synthase  33.61 
 
 
435 aa  155  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  31.74 
 
 
480 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  30.71 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  35.36 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  33.33 
 
 
446 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1482  flagellum-specific ATP synthase  32.23 
 
 
436 aa  153  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  33.43 
 
 
431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2155  flagellar protein export ATPase FliI  32.87 
 
 
434 aa  153  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  32.3 
 
 
438 aa  153  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  32.58 
 
 
445 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  33.23 
 
 
441 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  34.84 
 
 
460 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  32.45 
 
 
443 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.58 
 
 
437 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  31.75 
 
 
448 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  30.66 
 
 
471 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  32.26 
 
 
445 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  32.26 
 
 
439 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1091  flagella ATPase FliI  32.69 
 
 
464 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.09 
 
 
467 aa  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  33.64 
 
 
470 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>