More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1731 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1731  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  100 
 
 		 508 aa  1006    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0569  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  46.51 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0080  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  38.69 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.682648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0081  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  38.69 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0082  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  38.69 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.508572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0078  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  38.69 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0078  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  38.69 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  37.7 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00043  hypothetical protein  37.7 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.721093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3559  choline/carnitine/betaine transporter  37.5 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0042  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  37.5 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3615  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  37.5 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0041  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  37.5 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.206145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  37.5 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  37.5 
 
 		 504 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3229  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  37.38 
 
 		 514 aa  359  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4038  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  36.96 
 
 		 519 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2676  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  35.93 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4071  choline/carnitine/betaine transporter  36.96 
 
 		 650 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03056  hypothetical protein  36.56 
 
 		 632 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4104  choline/carnitine/betaine transporter  36.96 
 
 		 650 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4909  choline/carnitine/betaine transporter  35.78 
 
 		 527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00106  putative choline-glycine betaine transporter  35.77 
 
 		 586 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4862  putative carnitine transporter CglC  33.8 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.905862 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000396  choline-glycine betaine transporter  36.52 
 
 		 593 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2179  choline/carnitine/betaine transporter  35.34 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0014  choline/carnitine/betaine transporter  33.4 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2637  choline transporter  34.71 
 
 		 540 aa  296  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2691  choline transporter  34.71 
 
 		 540 aa  296  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1338  choline/carnitine/betaine transporter  31.34 
 
 		 542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2195  putative transporter  29.84 
 
 		 532 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.528619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2527  putative transporter  29.68 
 
 		 536 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.951849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1387  putative transporter  29.68 
 
 		 536 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.216138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1889  putative transporter  29.68 
 
 		 536 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2027  putative transporter  29.48 
 
 		 536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.12575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3247  BCCT transporter  30.4 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1754  putative transporter  30.79 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1618  putative transporter  30.79 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1515  putative transporter  30.58 
 
 		 548 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01771  predicted transporter  29.8 
 
 		 481 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1842  choline/carnitine/betaine transporter  29.91 
 
 		 476 aa  257  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.220871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01759  hypothetical protein  29.8 
 
 		 481 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1832  putative transporter  29.8 
 
 		 481 aa  257  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.301874 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2342  BCCT transporter  31.2 
 
 		 525 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  31.43 
 
 		 659 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  31.43 
 
 		 659 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  29.24 
 
 		 657 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  29.32 
 
 		 551 aa  229  8e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  30.81 
 
 		 506 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  30.98 
 
 		 681 aa  226  9e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  30.58 
 
 		 508 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1261  choline/carnitine/betaine transporter family protein  28.72 
 
 		 522 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  32.22 
 
 		 494 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3745  choline/carnitine/betaine transporter  30.58 
 
 		 724 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6160  choline transporter BetT  29.08 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  31.58 
 
 		 505 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  31.58 
 
 		 505 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  30.57 
 
 		 681 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  29.33 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  29.82 
 
 		 684 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  29.45 
 
 		 685 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  31.58 
 
 		 505 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  31.58 
 
 		 505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  31.58 
 
 		 505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  31.58 
 
 		 505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  33.48 
 
 		 523 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  31.16 
 
 		 520 aa  216  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  31.16 
 
 		 520 aa  216  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  32.65 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  30.9 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  32.4 
 
 		 504 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  31.48 
 
 		 637 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  30.24 
 
 		 667 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  32.26 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  31.56 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  31.85 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3857  putative transporter  26.01 
 
 		 548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.187176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  31.1 
 
 		 505 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70980  choline transporter BetT  29.49 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.92652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3496  choline/carnitine/betaine transporter  30.15 
 
 		 724 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.81429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  33.2 
 
 		 567 aa  213  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1835  choline/carnitine/betaine transporter  28.63 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  30.57 
 
 		 658 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  30.45 
 
 		 656 aa  210  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  29.39 
 
 		 661 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  29.92 
 
 		 682 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  30.8 
 
 		 682 aa  209  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  30.04 
 
 		 673 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  29.75 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  29.28 
 
 		 530 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  30.83 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  30.32 
 
 		 660 aa  208  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  29.48 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  30.69 
 
 		 498 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  29.87 
 
 		 542 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  30.57 
 
 		 606 aa  207  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  33.55 
 
 		 525 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  28.98 
 
 		 661 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0404  choline/carnitine/betaine transporter  27.63 
 
 		 667 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.766464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  30.19 
 
 		 525 aa  206  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>