More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3466 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 256 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  75.09 
 
 		 265 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  63.67 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  54.15 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  52.21 
 
 		 235 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  43.8 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  42.56 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  41.32 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  39.16 
 
 		 234 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  41 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  38.87 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  47.67 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  38.35 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  41.67 
 
 		 240 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1660  cytochrome c oxidase, subunit III  44.79 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  41.98 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  39.17 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  41.74 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  38.59 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  38.59 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  38.33 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  39 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  39.11 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  39.11 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  35.37 
 
 		 832 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  34.6 
 
 		 208 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.46 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.46 
 
 		 202 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 205 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.76 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.75 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  30.95 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  26.67 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  26.67 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  27.35 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  28.76 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  30.42 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  28.16 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  28.83 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  31.73 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.52 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  28.63 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  28.63 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  30.58 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.9 
 
 		 819 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.74 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  34.15 
 
 		 743 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  27.87 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  27.94 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  28.63 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  30.29 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  27.53 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  28.39 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  29.44 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  29.44 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  30.6 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  29.44 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  27.53 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.95 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  27.16 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  31.28 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  29.11 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  27.46 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  29.03 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  28.63 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  28.51 
 
 		 827 aa  69.7  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  29.01 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  27.53 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  30.82 
 
 		 825 aa  68.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  29.89 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  30.62 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  28.49 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  27.35 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  29.02 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  32.12 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  26.13 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  31.52 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  27.68 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  28.57 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  25.51 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  30.36 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  32.47 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  31.95 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  32.48 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  28.16 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  31.52 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  27.66 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  28.16 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  26.44 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  25.85 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.74 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.81 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  29.65 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  28.63 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>