More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1958 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
298 aa  587  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  63.29 
 
 
283 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  48.25 
 
 
319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  32.57 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  31.82 
 
 
291 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 
291 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 
291 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  33.55 
 
 
291 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  33.55 
 
 
291 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  30.42 
 
 
291 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  33.77 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  42.21 
 
 
291 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  32.46 
 
 
291 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  44.13 
 
 
208 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  33.22 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  32.9 
 
 
291 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  42.21 
 
 
291 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  42.21 
 
 
291 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  31.29 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  33.93 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  41.18 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  42 
 
 
295 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  32.01 
 
 
292 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  44.76 
 
 
296 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  41.33 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  41.33 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  31.68 
 
 
292 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  31.92 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  34.38 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  46.67 
 
 
295 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  44.96 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  44.19 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  30.94 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  32.06 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  34.88 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  45.93 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  34.29 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  45.74 
 
 
286 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 
212 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  33.44 
 
 
439 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  41.48 
 
 
199 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  33.44 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  40.91 
 
 
199 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  36.51 
 
 
211 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 
292 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  37.82 
 
 
275 aa  110  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  42.29 
 
 
204 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  39.35 
 
 
291 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  37.84 
 
 
239 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  29.45 
 
 
294 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 
274 aa  109  6e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  42.07 
 
 
304 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  42.03 
 
 
274 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  42 
 
 
295 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  44.36 
 
 
294 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  44.96 
 
 
286 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  44.96 
 
 
286 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.22 
 
 
198 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  38.76 
 
 
194 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  38.02 
 
 
279 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  31.67 
 
 
293 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  43.41 
 
 
286 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  40.67 
 
 
295 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 
208 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  36.26 
 
 
209 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  35.35 
 
 
291 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  39.33 
 
 
298 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  40.31 
 
 
288 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  31.41 
 
 
291 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  38.2 
 
 
205 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  35.75 
 
 
195 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  40.58 
 
 
274 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  40.6 
 
 
283 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  38.86 
 
 
197 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  34.03 
 
 
200 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  35.16 
 
 
209 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  40.13 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  42.64 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  31.87 
 
 
284 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.22 
 
 
205 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.22 
 
 
205 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  41.86 
 
 
285 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  41.86 
 
 
285 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  44.19 
 
 
291 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  39.06 
 
 
205 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  41.09 
 
 
285 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  41.09 
 
 
285 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  41.86 
 
 
285 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  41.09 
 
 
285 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  41.86 
 
 
285 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.69 
 
 
204 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.69 
 
 
204 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  32.66 
 
 
206 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  41.09 
 
 
285 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  30.36 
 
 
284 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  37.5 
 
 
200 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 
200 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  41.09 
 
 
285 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  32.49 
 
 
201 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  33 
 
 
284 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>