More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  78.47 
 
 		 204 aa  328  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  72.33 
 
 		 220 aa  300  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  70.87 
 
 		 220 aa  296  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  70.39 
 
 		 203 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  70.39 
 
 		 203 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  69.46 
 
 		 197 aa  295  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  68.45 
 
 		 203 aa  291  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  67.98 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  67.98 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  67.98 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  67.49 
 
 		 197 aa  288  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  66.99 
 
 		 205 aa  285  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  64.95 
 
 		 208 aa  267  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  70.97 
 
 		 180 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  63.11 
 
 		 200 aa  261  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  66.18 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  64.95 
 
 		 212 aa  250  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  61.39 
 
 		 199 aa  249  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  60.89 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  65.59 
 
 		 181 aa  248  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  64.95 
 
 		 239 aa  246  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  58.85 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  56.11 
 
 		 215 aa  222  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  58.16 
 
 		 194 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  55.71 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  55.5 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  59.9 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  55.61 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  55.96 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  58.16 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  53.55 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.5 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  56.86 
 
 		 218 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  53.39 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  50.89 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  48.86 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  53.43 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  49.28 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  55.61 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  45.61 
 
 		 244 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  43.16 
 
 		 198 aa  140  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  32.85 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.54 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  35.79 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  36.65 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.62 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  34.45 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  35.87 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  34.38 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  36.96 
 
 		 743 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.74 
 
 		 295 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  35.16 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  40.38 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  34.34 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  33.33 
 
 		 198 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  39.74 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  44.62 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.74 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.95 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  36.13 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  36.13 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  32.37 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  40.38 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  38.54 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  39.1 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  40.38 
 
 		 295 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  35.58 
 
 		 273 aa  99  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  37.19 
 
 		 291 aa  98.6  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 298 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4602  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.85 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  30.8 
 
 		 293 aa  98.2  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.43 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  34.42 
 
 		 292 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0770  quinol oxidase, subunit III  32.85 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0667  quinol oxidase subunit III  32.85 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0611  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  32.85 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0612  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  32.85 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0828  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.85 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.517619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 		 291 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  34.78 
 
 		 291 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0701  quinol oxidase subunit III  32.85 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0735  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.85 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  33.67 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  36.7 
 
 		 285 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  34.38 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  34.42 
 
 		 292 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  35.89 
 
 		 284 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  31.66 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  36.98 
 
 		 284 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  31.66 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  36.7 
 
 		 285 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  33.33 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  38.71 
 
 		 293 aa  94.7  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  38.46 
 
 		 293 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  36.24 
 
 		 285 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.88 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  38.61 
 
 		 279 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>