More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3250 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  67.49 
 
 		 224 aa  292  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  66.98 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  69.19 
 
 		 211 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  69.65 
 
 		 218 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  63.43 
 
 		 217 aa  285  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  66.5 
 
 		 212 aa  285  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  64.32 
 
 		 213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  65.52 
 
 		 212 aa  278  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  61.86 
 
 		 215 aa  274  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  61.01 
 
 		 215 aa  271  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  62.56 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  59.8 
 
 		 194 aa  234  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  56.62 
 
 		 208 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  62.19 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  56.94 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.64 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  60.71 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  56.02 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  56.37 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  58.59 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  57.5 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  58.59 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  56.74 
 
 		 204 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  56.57 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  56.57 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  53.98 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  52.97 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  56.57 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  57.07 
 
 		 197 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  56.57 
 
 		 197 aa  208  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  56.57 
 
 		 197 aa  208  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  57.07 
 
 		 197 aa  208  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  56.57 
 
 		 197 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  57.81 
 
 		 180 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  54.55 
 
 		 203 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  50.91 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  52 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  52.09 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  50.89 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  55.61 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  39.52 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  37.38 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  35.58 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  38.57 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.14 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  33.95 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.71 
 
 		 198 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  33.48 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  33.64 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  35.75 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  35.75 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.27 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.22 
 
 		 209 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.5 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  28.9 
 
 		 203 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  35.32 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.8 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.4 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  31.02 
 
 		 743 aa  94.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  34.86 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  31.16 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  32.08 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1546  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.47 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  32.62 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1875  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.47 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0147055  normal  0.117743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  29.49 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  32.39 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  29.76 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  28.5 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.28 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.62 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5610  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.32 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.22 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.43 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.39 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.64 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.85 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  27.78 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  34.04 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  33.17 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  33.16 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.77 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  32.82 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.77 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.78 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  32.69 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  35.79 
 
 		 298 aa  86.3  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.55 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  29.28 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>