More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0964 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  56 
 
 		 215 aa  241  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.56 
 
 		 213 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  56.02 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  55.9 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  57.41 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  54.42 
 
 		 205 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  54.42 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  52.02 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  54.55 
 
 		 208 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  53.11 
 
 		 197 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  52 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  58.04 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  54.88 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  53.74 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  52.63 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  52.63 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  52.63 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  52.02 
 
 		 199 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  59.42 
 
 		 205 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.55 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  50.22 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  52.23 
 
 		 203 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  52.23 
 
 		 203 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  52.15 
 
 		 197 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  51.12 
 
 		 199 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  49.78 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  51.79 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  52.23 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  54.29 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  50.69 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  53.11 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  53.3 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  53.92 
 
 		 180 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  52.23 
 
 		 205 aa  201  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  54.07 
 
 		 206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  48 
 
 		 212 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  51.42 
 
 		 194 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  52.38 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  47.41 
 
 		 244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  52.2 
 
 		 181 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  41.63 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  33.48 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  33.18 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  34.39 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  33.33 
 
 		 198 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.05 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  34.67 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  34.67 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  35.05 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.22 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  38.15 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  38.15 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  37.14 
 
 		 291 aa  99  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  33.64 
 
 		 295 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  32.71 
 
 		 291 aa  98.6  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 295 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.19 
 
 		 295 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.5 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  32.52 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.19 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  39.19 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  33.18 
 
 		 298 aa  95.9  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  36.99 
 
 		 291 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  36.99 
 
 		 291 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  35.1 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  37.57 
 
 		 291 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  34.68 
 
 		 291 aa  95.5  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  37.14 
 
 		 291 aa  95.1  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  31.71 
 
 		 283 aa  95.1  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 203 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  32.87 
 
 		 293 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  36.42 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  31.39 
 
 		 291 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  31.67 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  36.42 
 
 		 291 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  29.77 
 
 		 297 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  33.71 
 
 		 293 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  31.07 
 
 		 291 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  30.6 
 
 		 284 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  35.03 
 
 		 294 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  30.93 
 
 		 202 aa  91.7  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  32.71 
 
 		 293 aa  91.7  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  31.48 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  33.18 
 
 		 294 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  34.87 
 
 		 289 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 		 285 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 		 285 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  31.48 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  39.19 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  31.28 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  38.51 
 
 		 295 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  44.76 
 
 		 286 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 		 286 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  32.41 
 
 		 293 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>