More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1446 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 213 aa  430  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  83.57 
 
 		 213 aa  363  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  74.18 
 
 		 215 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  73.4 
 
 		 218 aa  313  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  71.83 
 
 		 211 aa  307  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  66.67 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  68.08 
 
 		 212 aa  298  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  66.98 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  60.09 
 
 		 215 aa  267  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  64.97 
 
 		 212 aa  264  8e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  63.13 
 
 		 217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.66 
 
 		 244 aa  241  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  63.46 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  60.41 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  61.32 
 
 		 220 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  57.01 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  62 
 
 		 205 aa  227  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  63.32 
 
 		 203 aa  227  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  63.32 
 
 		 203 aa  227  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  59.62 
 
 		 197 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  58.85 
 
 		 200 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  62.31 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  58.69 
 
 		 197 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  58.69 
 
 		 197 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  58.69 
 
 		 197 aa  224  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  55.35 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  57.75 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  54.42 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  57.65 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  61.31 
 
 		 203 aa  218  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  59.81 
 
 		 204 aa  217  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  54.46 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  54.93 
 
 		 199 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  55.83 
 
 		 194 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  63.02 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.96 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  59 
 
 		 208 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  57 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  57.29 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  50.91 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  50.91 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  41.71 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  35.85 
 
 		 195 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  34.72 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  33.65 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  34.98 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  36.19 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  39.2 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  37.63 
 
 		 198 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  34.62 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  40.64 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  36.92 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  37.33 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.92 
 
 		 198 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  36.68 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  35.71 
 
 		 743 aa  98.2  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.88 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.88 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.36 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  36.71 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  30.73 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.77 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  37.07 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 		 283 aa  91.3  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.2 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  42.95 
 
 		 293 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.82 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  34.83 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  38.03 
 
 		 304 aa  88.6  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.73 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  32.43 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3825  cytochrome c oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  29.49 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.23 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  33.87 
 
 		 298 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.73 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  31.91 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.1 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0950  cytochrome c oxidase subunit III  31.35 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454047  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.37 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  31.13 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.94 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  37.04 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.89 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.89 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 		 295 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.27 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 		 295 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 		 295 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.48 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  38 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>