More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1677 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  64.08 
 
 		 205 aa  261  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  60.83 
 
 		 215 aa  259  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  69.4 
 
 		 205 aa  257  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  61.84 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  57.55 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  57.08 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  60 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  60.49 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  56.68 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  58.41 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  59.8 
 
 		 212 aa  235  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  63.73 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.01 
 
 		 213 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  61.42 
 
 		 218 aa  234  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  62 
 
 		 200 aa  234  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  62.63 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  58.45 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  61.62 
 
 		 199 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  60.3 
 
 		 197 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  58.74 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  58.74 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.08 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  63.76 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  59.8 
 
 		 197 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  56.94 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  59.8 
 
 		 197 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  59.8 
 
 		 197 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  59.8 
 
 		 197 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  57.89 
 
 		 220 aa  225  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  58.5 
 
 		 220 aa  224  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  60.2 
 
 		 204 aa  224  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  56.31 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  55.35 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  58.79 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  62.09 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.3 
 
 		 217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  58.21 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  57.44 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  53.57 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  48.21 
 
 		 244 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  43.43 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  34.16 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  36.18 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  38.25 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  38.25 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  35.48 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  36.02 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  35.03 
 
 		 206 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  35.14 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  34.95 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  33.99 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  36.02 
 
 		 283 aa  104  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  34.59 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  39.71 
 
 		 304 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.91 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  29.65 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.51 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 222 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.78 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  35.8 
 
 		 298 aa  95.1  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.29 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.29 
 
 		 213 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  40.15 
 
 		 294 aa  94.7  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.91 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.11 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1635  CyoC  31.47 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00622543  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  40.91 
 
 		 293 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.11 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1875  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.85 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0147055  normal  0.117743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1546  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.32 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  41.67 
 
 		 291 aa  91.7  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 		 295 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.58 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  33.91 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  38.64 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.39 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  30.65 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  40.91 
 
 		 291 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  31.22 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  33.71 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  30.69 
 
 		 295 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  40.91 
 
 		 291 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  40.91 
 
 		 291 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  41.67 
 
 		 291 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  41.67 
 
 		 291 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5011  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.65 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565569  normal  0.0682866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  30.58 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  28.71 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.94 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>