More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1828 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  46.99 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  46.99 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  45.95 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  45.65 
 
 		 220 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  46.45 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  44.02 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  43.14 
 
 		 206 aa  150  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  45.65 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  45.65 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  45.65 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  45.65 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  45.99 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  42.45 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  47.49 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  45.11 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  42.45 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  44.67 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  43.48 
 
 		 220 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  43.81 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  41.71 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  41.33 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  41.84 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  44.56 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  41.87 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  43.14 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  44.92 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  44.75 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  41.71 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  43.16 
 
 		 209 aa  140  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  42.05 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  42.16 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  43.59 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  41.15 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  41.63 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  42.71 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  42.93 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  39.52 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  43.78 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  41.71 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  42.4 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  43.17 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  39.43 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  39.43 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  37.89 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  36.04 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  36.67 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  36.21 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  36.61 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  37.04 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.16 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  34.44 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  35.43 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  37.04 
 
 		 292 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  35.43 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  38.07 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  38.07 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.5 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  36.57 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  36.93 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.47 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  38.33 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  32.96 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  36.76 
 
 		 273 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2105  cytochrome c oxidase, subunit III  35.52 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  34.86 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  28.49 
 
 		 234 aa  95.1  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  34.66 
 
 		 200 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2835  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.36 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  32.31 
 
 		 198 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1975  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.16 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1211  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.71 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  33 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  36.57 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  34.66 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5374  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  34.97 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  35.23 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1635  CyoC  31.5 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00622543  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2088  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.16 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  33 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6008  cytochrome c oxidase, subunit III  35.16 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0674382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  33.72 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2069  cytochrome c oxidase, subunit III  35.16 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  33 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2716  ubiquinol oxidase, subunit III  35.36 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.089432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  34.66 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2774  ubiquinol oxidase, subunit III  35.36 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  37.82 
 
 		 284 aa  91.7  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  32.56 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  34.86 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  34.1 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  39.6 
 
 		 295 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0991  ubiquinol oxidase, subunit III  32.5 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.81 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>