More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_04981 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  98.51 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  77.55 
 
 
206 aa  323  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  69.57 
 
 
207 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  73.13 
 
 
200 aa  304  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  71.14 
 
 
200 aa  296  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  71.14 
 
 
200 aa  295  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  70.65 
 
 
200 aa  295  3e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  66.03 
 
 
209 aa  294  6e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  67.16 
 
 
201 aa  292  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  52.75 
 
 
195 aa  201  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  53.55 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  52.46 
 
 
207 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  50.26 
 
 
208 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  47.59 
 
 
214 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  50.28 
 
 
205 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  50.28 
 
 
205 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  43.75 
 
 
211 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  45.3 
 
 
210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  41.29 
 
 
198 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  40.3 
 
 
197 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  38.24 
 
 
204 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  35.15 
 
 
201 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  36.14 
 
 
200 aa  121  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  33.82 
 
 
204 aa  121  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  36.12 
 
 
294 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  42.24 
 
 
297 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  44.85 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5610  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.31 
 
 
218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  43.54 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.32 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  41.25 
 
 
291 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  41.25 
 
 
291 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  41.25 
 
 
291 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  43.54 
 
 
295 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  41.25 
 
 
291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  41.25 
 
 
291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  40.62 
 
 
291 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  35.09 
 
 
284 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  39.75 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  40.37 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
291 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  42.34 
 
 
295 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  35.32 
 
 
291 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  36.22 
 
 
229 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  40.62 
 
 
291 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  41.33 
 
 
295 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  35.23 
 
 
283 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  42.34 
 
 
295 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  39.74 
 
 
285 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  33.5 
 
 
274 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  39.86 
 
 
286 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.96 
 
 
199 aa  104  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1546  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.82 
 
 
221 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  42.34 
 
 
295 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.32 
 
 
291 aa  104  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  32.96 
 
 
200 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  40.37 
 
 
293 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1875  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 
221 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0147055  normal  0.117743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  39.1 
 
 
285 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  42.34 
 
 
291 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  37.79 
 
 
295 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  40.37 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  42.03 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.74 
 
 
215 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  39.13 
 
 
286 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  43.07 
 
 
295 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.74 
 
 
215 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  37.14 
 
 
204 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  41.3 
 
 
286 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  34.4 
 
 
291 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  41.3 
 
 
286 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  43.07 
 
 
298 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  42.34 
 
 
295 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
285 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  31.84 
 
 
198 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
285 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
285 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
285 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
285 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.1 
 
 
205 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.97 
 
 
202 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 
285 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  35.43 
 
 
198 aa  102  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  32.49 
 
 
298 aa  101  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  43.07 
 
 
293 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  41.3 
 
 
285 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  41.61 
 
 
296 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  41.3 
 
 
285 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.04 
 
 
208 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  38.51 
 
 
286 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
291 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  34.55 
 
 
208 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  37.77 
 
 
222 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 
285 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.21 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  40.88 
 
 
293 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  35.68 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  39.13 
 
 
285 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>