More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3520 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  84.14 
 
 		 291 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  82.07 
 
 		 291 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  82.41 
 
 		 291 aa  500  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  84.48 
 
 		 291 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  83.79 
 
 		 291 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  84.48 
 
 		 291 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  84.14 
 
 		 291 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  84.14 
 
 		 291 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  84.14 
 
 		 291 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  83.1 
 
 		 293 aa  478  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  84.48 
 
 		 291 aa  480  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  83.1 
 
 		 291 aa  477  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  83.45 
 
 		 291 aa  471  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  80.34 
 
 		 291 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  79.31 
 
 		 291 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  70.24 
 
 		 297 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  69.2 
 
 		 293 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  68.73 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  67.81 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  62.76 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  59.79 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001448  cytochrome c oxidase polypeptide III  68.15 
 
 		 295 aa  351  8.999999999999999e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  56.04 
 
 		 295 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  57.77 
 
 		 295 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  57.77 
 
 		 295 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  57.24 
 
 		 295 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  57.43 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  57.38 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  57.38 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  57.05 
 
 		 295 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  57.48 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  53.45 
 
 		 291 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  55.41 
 
 		 295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  50.16 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  54.9 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  55.93 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  54.92 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  49.13 
 
 		 291 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  51.03 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  52.05 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  54.95 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  51.36 
 
 		 288 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  50.34 
 
 		 288 aa  268  8e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  48.97 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  51.54 
 
 		 286 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  52.26 
 
 		 290 aa  254  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  47.08 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  46.94 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  48.12 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  47.3 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  46.58 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  46.23 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  46.6 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  45.52 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  51.22 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  45.17 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  50.17 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  50.52 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  46.34 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  49.83 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  49.83 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  44.52 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  47.2 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  47.04 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  46.69 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  46.69 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  46.69 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  46.69 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  46.69 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  46.69 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  46.69 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  46.85 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  46.5 
 
 		 285 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  46.85 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  47.2 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  46.85 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  46.5 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  46.5 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  46.5 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  46.5 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  46.34 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  40.14 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  37.5 
 
 		 292 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  37.5 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  38.59 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  38.51 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  39.1 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  37.04 
 
 		 439 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  37.29 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  37.29 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  37.93 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  39.66 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 291 aa  161  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  38.75 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  37.72 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  38.75 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>