More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3135 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  80.31 
 
 		 194 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  70.62 
 
 		 205 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  63.16 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  62.1 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  61.43 
 
 		 203 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  61.43 
 
 		 203 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  61.35 
 
 		 200 aa  236  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  63.73 
 
 		 206 aa  235  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  64.55 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  64.55 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  64.55 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  62.62 
 
 		 199 aa  234  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  56.62 
 
 		 219 aa  234  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  60 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  64.02 
 
 		 197 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  60.29 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  62.14 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  61.06 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  59.52 
 
 		 220 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  62.96 
 
 		 197 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.92 
 
 		 213 aa  230  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  61.06 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  65.78 
 
 		 180 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  57.01 
 
 		 213 aa  228  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  62.56 
 
 		 217 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  59.62 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  58.57 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  56.56 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  56.16 
 
 		 215 aa  221  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  54.84 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  61.78 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  62.77 
 
 		 204 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.81 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  55.25 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  58.74 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  58.16 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  60.96 
 
 		 181 aa  207  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  49.77 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  53.3 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  50.22 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  41.15 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  34.47 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  38.02 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  38.19 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  35.75 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  36.55 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  38.83 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  38.17 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  38.17 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  36.32 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.21 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  36.96 
 
 		 283 aa  111  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  35.1 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.46 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  35.85 
 
 		 743 aa  104  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  34.63 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  36.41 
 
 		 229 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  42.75 
 
 		 294 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  34.55 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  33.66 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  34.95 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  40.26 
 
 		 296 aa  98.6  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  34.21 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  32.69 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  35.51 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  29.11 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.72 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  34.42 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.4 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.83 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.4 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  32.21 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  38.12 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  37.57 
 
 		 292 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  37.65 
 
 		 295 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  35.41 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  34.16 
 
 		 295 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  30.69 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.92 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  37.04 
 
 		 292 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  31.73 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  32.86 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  32.2 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  36.88 
 
 		 295 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 		 293 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  33.89 
 
 		 319 aa  92  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  36.25 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4060  cytochrome c oxidase, subunit III  31.66 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3989  cytochrome c oxidase, subunit III  31.66 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4044  cytochrome c oxidase, subunit III  31.66 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  33.9 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3685  cytochrome c oxidase, subunit III  31.66 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3702  cytochrome c oxidase, subunit III  31.66 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4152  cytochrome c oxidase subunit III  31.66 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.951057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  36.61 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>