More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1022 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  80.31 
 
 		 208 aa  328  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  69.68 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  67.02 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  60.98 
 
 		 215 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  63.73 
 
 		 206 aa  234  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  64.71 
 
 		 217 aa  234  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  59.8 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  60.85 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  60.85 
 
 		 203 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  60.85 
 
 		 203 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  59.79 
 
 		 197 aa  227  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  60.21 
 
 		 205 aa  227  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  59.79 
 
 		 197 aa  227  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  59.79 
 
 		 197 aa  227  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  59.26 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  62.77 
 
 		 204 aa  224  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  58.33 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  61.19 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  58.16 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  61.17 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  61.08 
 
 		 180 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  61.17 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  58.2 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  60.64 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  59.26 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  58.2 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  55.83 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.92 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  56.08 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  57.77 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  54.9 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  53.4 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  54.19 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  57.07 
 
 		 208 aa  208  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  59.89 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  52.45 
 
 		 212 aa  207  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  55.39 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  51.23 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  51.42 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  48.82 
 
 		 244 aa  178  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  42.93 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  37.77 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  37.84 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  39.04 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  36.84 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.6 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.7 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  36.32 
 
 		 206 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  36.13 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  35.42 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.64 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  34.9 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  38.71 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  38.71 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  38.76 
 
 		 298 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  37.02 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 		 208 aa  101  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  36.46 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  35.86 
 
 		 743 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  35.26 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  33.9 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  43.51 
 
 		 294 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.55 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.29 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.29 
 
 		 213 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  39.55 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  36.13 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  40.26 
 
 		 296 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  41.22 
 
 		 304 aa  94.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  35.98 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  35.03 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  36.11 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.67 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.67 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.07 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  34.25 
 
 		 319 aa  94  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  36.11 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3989  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4060  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3702  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  36.45 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4044  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1195  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3768  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3854  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3685  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.56 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4152  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.951057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3957  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.13 
 
 		 295 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.03 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.03 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  35.03 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.81 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  34.2 
 
 		 220 aa  91.3  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 		 215 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>