More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2209 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  93.87 
 
 		 224 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  69.48 
 
 		 213 aa  300  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  68.08 
 
 		 213 aa  298  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  68.4 
 
 		 212 aa  294  6e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  66.51 
 
 		 215 aa  291  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  66.67 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  69.15 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  66.5 
 
 		 219 aa  285  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  61.79 
 
 		 215 aa  277  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.34 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  59.2 
 
 		 206 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  56.6 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  58.29 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  61.34 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  59.6 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  59.6 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  61.5 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  59.6 
 
 		 220 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  60.5 
 
 		 205 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  54.26 
 
 		 244 aa  224  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  58.59 
 
 		 220 aa  224  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  59.62 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  57.08 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  56.56 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  57.14 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  58.59 
 
 		 203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  56.6 
 
 		 197 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  56.6 
 
 		 197 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  56.6 
 
 		 197 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.5 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  55.5 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  55.19 
 
 		 199 aa  217  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  54.25 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  55.19 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  58.85 
 
 		 180 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  52.65 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  50.22 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  52.45 
 
 		 194 aa  207  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  51.33 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  58.55 
 
 		 181 aa  204  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  42.45 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  33.01 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  36.45 
 
 		 214 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  35.92 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  35.81 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.85 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.86 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  35.05 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  35.98 
 
 		 198 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  36.22 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  36.22 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  35.86 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  35.11 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  33.83 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  38.81 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  36.17 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  34.57 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  36.46 
 
 		 743 aa  98.6  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  35.11 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  31.71 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.74 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.46 
 
 		 298 aa  92  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  40.12 
 
 		 295 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  41.61 
 
 		 295 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  41.61 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  41.61 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  34.03 
 
 		 304 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.09 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  30.73 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  39.53 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.23 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.05 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  35.26 
 
 		 229 aa  89  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  32.87 
 
 		 295 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  29.77 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  40.27 
 
 		 291 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.82 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  32.81 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  38.93 
 
 		 291 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  38.93 
 
 		 291 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  34.59 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  34.03 
 
 		 222 aa  87  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  38.93 
 
 		 295 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.43 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  32.47 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.73 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  40.54 
 
 		 296 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.97 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  28.92 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.97 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  33.85 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  33.85 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  38.93 
 
 		 291 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  38.93 
 
 		 291 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  37.58 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0984  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  31.22 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  37.58 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>